Изгнанный Стюарт не нашел поддержки также при папском дворе. Иннокентий XI (1676–1689) был недоволен тесными контактами Якова II с иезуитами в 1685–1688 гг.[1785], его увлечением галликанскими и янсенистскими[1786] идеями. В целом, понтифик считал, что активная религиозная политика Якова II в трех Британских королевствах способна нанести больше вреда «делу истинной религии», чем укрепить позиции британских католиков[1787]. В феврале 1689 гг. паж Якова II — полковник Джеймс Портер — отправился с миссией в Рим. Его целью было добиться создания католической оборонительной лиги против «северных протестантских князей» под эгидой римского папы[1788]. Посланнику Стюарта был оказан холодный прием. Преемники Иннокентия XI — Александр VIII (1689–1691) и Иннокентий XII (1691–1700) — вели себя в отношении якобитов столь же осторожно, предпочитая союз с Габсбургами. Немногие влиятельные при Римской курии лица, представлявшие интересы Якова II при папском дворе, постепенно сошли со сцены. Филип Ховард, носивший титул кардинала Норфолка и возглавлявший в Риме партию британского католического духовенства, умер в 1694 г. Итальянец кардинал д'Эсте, дядя королевы Марии Моденской, получивший в 1688 г. по ее ходатайству пост Покровителя Британии, все больше ориентировался на австрийский двор и постепенно отошел от поддержки Якова II[1789]. К 1696 г. отношения между Сен-Жерменом и Римом настолько охладели, что заместитель государственного секретаря графа Мидлтона Дэвид Нэрн получил распоряжение «свести переписку с Римом до минимума»[1790].

Людовик XIV, вероятно, надеясь избавиться от Якова II, в 1696 г. предложил своему кузену выставить свою кандидатуру на выборах короля в Речи Посполитой. Однако Яков II отказался, опасаясь, что, завладев польской короной, он отрежет себе путь к реставрации в Британии[1791].

Важнейшим рубежом в политической деятельности Якова II стало подписание в 1697 г. странами-участницами войны Аугсбургской лиги мирного договора в Рисвике. К концу 1696 г. французский король осознал, что его ресурсы истощены, и зимой 1696–1697 гг. начались мирные переговоры[1792]. Для истории якобитского движения эти события имели огромное значение, поскольку главными требованиями Вильгельма III были официальное признание Людовиком XIV его прав на корону Британии и удаление Якова II и его двора из Франции. Французский король не только категорически отказался выполнить последнее условие, но не согласился даже перенести резиденцию своего кузена из окрестностей Парижа на самый юг страны (подальше от рубежей с Британией) — в Авиньон[1793]. Французские дипломаты во время прелиминарий в марте 1696 г. в Падуе предложили компромиссное решение: назначить преемником Вильгельма III принца Уэльского[1794]. Однако оно было отклонено.