Пока ИНА боролся за переосмысление миссии атеизма с учетом новых социально-политических реалий, местные атеистические кадры критиковали центр за отсутствие руководящих указаний. Атеистические работники, приезжавшие на конференции ИНА, чтобы получить практические советы, как правило, уезжали обратно разочарованными. На одной такой конференции председатель атеистического совета московской фабрики «Красное знамя» пожаловался, что сотрудники ИНА ставят вопросы и сообщают информацию, но не дают ответов884. Комсомольский работник из Москвы заметил: «С точки зрения марксизма религия идет от нищеты и невежества. Но сейчас мы богаты, достаточно хорошо живем, но люди идут к богу»885. На другой конференции представитель Московского обкома партии задал вопрос о критериях религиозности и о том, должна ли религиозность измеряться доходами церкви, соблюдением обрядов или наличием икон886. Атеистические кадры также жаловались на застой в развитии теории и методов атеистической работы. Представитель Эстонии отметил, что материалы по атеистической работе, от книг по научному атеизму до лекционных программ, выпущены еще в хрущевскую эпоху и потому бесполезны, а новых пособий по атеистической работе не издают887. С ним согласилась лектор общества «Знание», директор школы из Загорска: «Можно взять план [атеистического воспитания в школе] 10-летней давности, и вы увидите эти же пункты и в теперешних планах. Почему? Потому что люди не знают, что делать, вернее, они знают, что делать, но не знают как». Жизнь, заключила она, «требует конкретные ответы на конкретные вопросы»888.

Все меньше ясности было и по вопросу о том, какую значимость партия на самом деле придает атеистической работе. Окулов доказывал, что даже если партия говорит о необходимости выработки научного мировоззрения, атеистическая работа для местных партийных органов остается далеко не самой приоритетной задачей. Он описывал ситуацию, с которой обычно сталкиваются представители центральных атеистических структур, когда во время поездок по стране они встречаются с местными партийными работниками: «Приходят в партийную организацию и спрашивают, кто сейчас отвечает за атеистическую работу? Называют Ивана Ивановича. А почему он, а не кто-нибудь другой? Да потому что, если поручить Ивану Ивановичу организационную работу, то он ее завалит. Дать ему партийное просвещение, также завалит, а тут делать нечего, вот мы и поручили это дело». Другой сотрудник атеистического аппарата описывал ситуацию так: «Говорят, что такое религия, за это особенно ругать не будут, а за другое будут. И пускают это дело на самотек». В результате, несмотря на значительные усилия и ресурсы, затраченные на подготовку кадров, в атеистическом аппарате по-прежнему недоставало квалифицированных сотрудников889.