Госпитальерская деятельность осуществляется через территориальные организации Ордена, то есть через Приораты и Суб-Приораты и, прежде всего, через Национальные Ассоциации и через Службу Помощи Суверенного Мальтийского Ордена.

В области своей госпитальерской деятельности Орден в наше время действует в 90 странах, где имеет свои собственные больницы, поликлиники, амбулатории, дома престарелых и инвалидов, Международный Банк Крови (на острове Мальта), лепрозории в странах Африки и Южной Америки, центры сбора и распределения медикаментов, центры лечения и реабилитации диабетиков, детские дома, школы сестер милосердия и другие благотворительные учреждения разного рода. Значительная поддержка оказывается в виде денежных пожертвований, поставок продовольствия, медикаментов, гигиенических средств, одежды и др.

Суверенный Мальтийский Орден имеет в своей собственности форт Сайт Анджело на острове Мальта, где находится резиденция Губернатора, а также дворец Великих Магистров на Авентинском холме в Риме и резиденцию на виа Кондотти. Орден имеет собственную денежную единицу: скудо = 12 тари = 240 грани (=480 итальянских лир) и чеканит собственную монету.

Почтовая служба Мальтийского Ордена было учреждена 20 мая 1966 года, а 15 ноября в продажу поступили первые орденские почтовые марки. Регулярный выпуск знаков почтовой оплаты начался в 1967 г. Они повествуют о деятельности Ордена Святого Иоанна в прошлом и настоящем.

В 1999 г. Суверенный Мальтийский Орден пышно отпраздновал «900-летие основания Мальтийского Ордена», а в 2009 — его «910-летие», хотя, как известно, Орден был основан вовсе не в 1099 г., а гораздо раньше, в самом начале XI в., и утвержден папой римским опять-таки не в 1099, а в 1113 году! Торжества, прошедшие в Святой Земле и на Родосе, на Мальте и в Италии, в России и многих других странах, должны были создать у международной общественности впечатление, что до взятия Иерусалима западными крестоносцами в 1099 году Орден иоаннитов, якобы, ничего из себя не представлял и обязан своим достойным упоминания существованием только римско-католической церкви!

Таким образом руководство современного «папского» Суверенного Мальтийского Ордена пытается стереть из исторической памяти человечества начальный, самый важный и трудный период истории иоаннитов, опекавшихся и духовно окормлявшихся при своих основателях Мауро (Мавре), Панталеоне и блаженном Герарде отнюдь не римскими понтификами, а православными Патриархами Иерусалима! Но истину скрыть невозможно никакими ухищрениями!