Целями ОПУ является, среди прочего, диалог с миром светской культуры, борьба с использованием православия в политических и националистических целях, противостояние религиозному экстремизму, фанатизму и суевериям. «Мы приглашаем к сотрудничеству не только преподавателей, но и студентов других исповеданий, ибо не только мы мало знаем о них, но и они крайне слабо, поверхностно, а зачастую и вульгарно представляют себе, что такое православие, — сказал священник Георгий Чистяков, много лет преподававший в ОПУ. — К сожалению, мы до сих пор живем мифами о других конфессиях. Если каждый из нас из глубины своего опыта откроется духовному опыту других, то мы увидим не разделения, а те чрезвычайно важные моменты, которые нас объединяют».
Таким образом, университет и сегодня продолжает традицию отца Александра Меня — традицию образования и просветительства в области гуманитарного знания.
«Я погружен в свои обычные труды, Вам известные: храм, писание, школа, воскресная школа, Библейское общество, издательские дела и пр., — пишет отец Александр Раисе Колесниковой летом 1990 года. — Теперь меня спокойно публикуют в разных органах — „Огонек“, „Наше наследие“, „Знание — сила“, „Наука и жизнь“, „Лат. Америка“ и т. д., включая газеты. За всё слава Богу. От лекций отдыхаю до 1 сентября… Веду постоянные передачи по радио. Приходят сотни писем, даже из тюрем. Сам не пойму, как успеваю отвечать хотя бы на часть».
«Однажды я спросил его: „Как Вы это выдерживаете? Где Вы берете силы?“ Он ответил: „Силы мне дает Евхаристия. Без нее не выдержал бы. Она удесятеряет силы“», — вспоминает Владимир Илюшенко.
Понимая, насколько важны воспитание детей в вере и приобщение их к церковной традиции, отец Александр всегда мечтал о создании полноценной воскресной школы при храме. Им давно была написана книга «Свет миру» — по сути, детское Евангелие, а София Рукова написала «Ветхозаветную историю для детей». В приходе к концу 80-х существовало уже множество христианских опер, мистерий, спектаклей, стихов и песен. В августе 1990 года отец Александр благословил Валентина Серебрякова на служение в качестве директора воскресной школы. «Начните с рассказов о праздниках, — благословлял батюшка Софию Рукову на преподавание в школе. — Пусть учатся петь праздничные тропари — родители, которые поют с Вами, помогут; рассказывайте о богослужении… Через неделю и начинайте. Пока по квартирам, „в гостях“, — помните, что уголовная статья еще действует. А там будет видно…»
Было решено первоначально принять в школу до пятнадцати детей из семей, проживающих в Пушкине и в Москве и записавших своих детей для участия в занятиях. И вот 2 сентября 1990 года торжественным молебном воскресная школа открылась. Отец Александр подходил к каждому ученику, спрашивал его имя и класс и, прикоснувшись к голове, благословлял. Затем он рассказал детям, по какой программе они будут учиться в этой школе и почему это важно, и представил им преподавателей из числа прихожан храма. «Мы будем говорить с вами о самом важном в жизни, — сказал отец Александр. — Хотя все вы юны, вы знаете, что каждому из нас суждено умереть. Христианская вера дает откровение на вопрос о том, что это значит для человека, и говорит о том, что человек, который строит свою жизнь так, как заповедовал ему Господь, на самом деле не умирает, а уходит в вечность».