Сотрудники милиции графства окружили дом Купера и потребовали, чтобы тот сдался. Сложно сказать, кто именно открыл стрельбу, но в завязавшейся перестрелке был ранен один из заместителей шерифа. Купер в своём автомобиле попытался скрыться, но на одной из автомобильных трасс ему преградил путь автомобиль с сотрудниками милиции, которые потребовали, чтобы тот сдался. Купер резко развернул автомобиль и помчался обратно к своему дому. Около дома он наткнулся на отряд представителей закона. Те в очередной раз предложили ему сдаться, но Купер приказу не подчинился. В ходе завязавшейся перестрелки Уильям Купер был убит.

В рапорте шерифа о финале событий той ночи сказано: «Отказавшись выполнять приказ сотрудников милиции, Купер выскочил из автомобиля и побежал в сторону своего дома, открыв на 6eiy стрельбу в сторону сотрудников правоохранительных органов». Правда, как замечают биографы Купера, в рапорте шерифа почему-то не упомянуто о том, что бегать Купер не мог — ещё во время службы в армии в ходе боевых действий он потерял правую ногу и носил протез.

Вернёмся к разоблачениям Уильяма Купера. В своём манифесте «Operation «Majority»» он утверждал, что изложенную в нём информацию он получил в то время, когда служил в разведывательных структурах ВМФ США, находясь в звании младшего офицера. Как объяснял сам Купер, источником информации для него послужили документы и реальные события того времени, когда он с 1972 года служил при главкоме Тихоокеанского флота США.

В тот период военно-морская контрразведка «ONI» («Office of Naval Intelligence») по заказу ВМФ проводила оперативные мероприятия относительно управляющей «Operation «Majority»» группы «MJ-12» с целью выяснить, что же это за проект и чем он на самом деле занимается. В результате противодействия спецслужб, как говорил Уильям Купер, военно-морское ведомство США потерпело поражение: его штат был существенно сокращён, и, кроме того, ВМФ США потерял контроль над рядом проектов, осуществлением которых он до этого занимался.

Купер, как уже говорилось, утверждал, что в рамках «Operation «Majority»» действует несколько взаимосвязанных подпроектов, наиболее любопытные из которых есть смысл перечислить.

В рамках проекта «Сигма» («Sigma») впервые была установлена связь с инопланетянами — и эта работа продолжается до сих пор.

Существует проект «Плато» («Plato»), в рамках которого осуществляются дипломатические отношения с инопланетянами. По утверждению Купера, было заключено формальное соглашение (с точки зрения Конституции США, конечно же, незаконное), согласно которому инопланетяне согласились снабжать Землю новыми технологиями. А в обмен на это они получили согласие на их тайное присутствие на Земле, гарантию невмешательства в их деятельность (в частности, разрешение на похищение людей и животных). При этом пришельцы согласились предоставлять «MJ-12» информацию о частоте и объёмах этих похищений.