В условиях войны возможности научно-исследовательской работы были значительно сужены. В 1943 г. на курсах было защищено 5 диссертаций, большинство которых были посвящены обобщению опыта Великой Отечественной войны. В апреле 1944 г. был утвержден новый состав Ученого совета курсов. В него вошли начальники ведущих кафедр, доктора и кандидаты наук, профессора и доценты из числа преподавателей. На первом заседании Ученого совета был принят план научно-исследовательской работы курсов[339].
В 1944 г. в штаты ВВВПК были включены пятимесячные курсы усовершенствования преподавателей социально-экономического цикла военных училищ, первый выпуск которых состоялся в ноябре 1944 г. Была восстановлена адъюнктура с трехлетним сроком обучения по кафедрам марксизма-ленинизма, партийно-политической работы, истории СССР, политической экономии, истории войн и военного искусства.
Важным средством повышения политических и военных знаний слушателей являлась хорошо организованная партийно-политическая работа на курсах. Политический отдел ВВВПК уделял большое внимание работе партийных организаций по обеспечению примерности слушателей в учебе и дисциплине. В целях воспитания высоких партийных качеств коммунистов на партийных собраниях ставились вопросы: «Больше партийности и организованности в работе»; «О достоинстве и чести советского офицера» и т. п. Политический отдел обобщал опыт партийно-политической работы слушателей, проводил совещания со слушателями различных должностных категорий по подведению итогов партийно-политической работы в операциях, осуществляемых Красной Армией[340].
К концу 1944 г. была восстановлена заочная подготовка кадров политработников. 14 ноября по решению Главного политического управления Красной Армии при ВВВПК создается трехгодичная заочная высшая военно-политическая школа Главного политического управления РККА с пунктами сбора в Москве, Ленинграде, Киеве, Харькове, Одессе, Минске, Ростове-на-Дону, Ташкенте, Свердловске, Новосибирске, Чите и Хабаровске[341]. Первый учебный сбор слушателей этой школы проходил в июле 1945 г.
Высшие всеармейские военно-политические курсы успешно решали сложные задачи подготовки кадров политработников. В ноябре 1944 г. 150 работников и слушателей курсов за безупречную и долголетнюю службу в рядах Вооруженных Сил СССР были награждены орденами и медалями. Из них орденом Красного Знамени – 39 человек, орденом Красной Звезды – 28 человек. 1 декабря 1944 г. начальник Главного политического управления Красной Армии А.С. Щербаков вручил ордена и медали награжденным[342].