Отмена института военных комиссаров была связана во многом с огромным дефицитом командирских кадров, создавшимся после поражений и неудач начального периода войны. Например, только в окружении под Киевом летом 1941 г. Красная Армия потеряла около 60 000 человек командного состава. Согласно Указу Президиума Верховного Совета СССР повсеместно упразднялся институт военных комиссаров и институт политических руководителей в подразделениях. На командиров (начальников) целиком возлагалась ответственность за все стороны жизни и деятельности частей, соединений и учреждений Красной Армии. В соединениях, частях, штабах, подразделениях, военно-учебных заведениях, центральных и главных управлениях комиссариата обороны и учреждениях Красной Армии вводился институт заместителей командиров по политчасти. Для политработников устанавливались общие для всех командиров воинские звания и знаки различия.
Введение полного единоначалия в Красной Армии обусловливалось и изменениями, произошедшими к этому времени на фронтах войны, уровнем подготовки командно-политического состава. К этому периоду командно-начальствующий состав вырос в военном и политическом отношении, накопил опыт руководства войсками, что позволило возложить на командиров ответственность за все стороны жизни и боевой деятельности личного состава. С другой стороны, введение полного единоначалия позволило политработникам сосредоточить все усилия на партийно-политической воспитательной работе с личным составом, укреплении воинской дисциплины.
Важно отметить, что введение единоначалия и упразднение института военных комиссаров не принизило значения политической работы, а придало ей новый размах. Присвоение политработникам командных званий повышало их роль и обязывало настойчиво овладевать военными знаниями, чтобы быть готовыми в любой момент занять командную должность. В то же время указывалось, что при проведении аттестования и присвоении командных званий политическим работникам следует исходить из того, что их основной задачей по-прежнему является партийно-политическая работа.
В русле поиска новых подходов к формированию государственно-патриотического сознания военнослужащих и лиц гражданского персонала вооруженных сил немаловажное значение приобретает исследование исторического опыта строительства военно-политических органов. От умения руководителей государственных и военных органов критически осмысливать и творчески использовать опыт этой работы, накопленный в советский период отечественной истории, в том числе в годы Гражданской и Великой Отечественной войн, в значительной мере зависит успешное решение проблемы формирования действенной системы военно-политической работы в армии и на флоте.