Как мы увидим дальше, сначала Хайду выступил против Чагатаидов. Между 1267-м и 1269 гг. он победил Чагатаида Барака, отнял у него Или и Кашгарию, оставив одну лишь Трансоксиану. Преемники Барака были всего лишь вассалами Хайду, который по собственному усмотрению назначал и смещал их. Став властелином Центральной Азии, Хайду принял титул каана и напал на Хубилая.

Вести войну против Хайду Хубилай поручил (1275) своему четвертому сыну, принцу Номухану, или Номохану, отправив его в армией в Алмалык (рядом с современной Кульджой, на Или). Номохана сопровождал блестящий штаб из принцев, в числе которых был его двоюродный брат Ширеки, сын Менгу, и Туктимур. В 1276 г. Туктимур, недовольный Хубилаем, вовлек Ширеки в заговор. Они вдвоем предательски захватили Номохана, объявили себя сторонниками Хайду и выдали Номохана хану Кипчака – Менгу-Тимуру, союзнику Хайду. В свой мятеж они вовлекли Сарабана, второго сына Чагатая, и других Чингизидов. Из Алмалыка Хайду пришел в Каракорум (1277). Положение Хубилая было очень сложным. Он отозвал из Китая лучшего своего полководца Баяна. Баян разбил Ширеки на Орхоне и отбросил к Иртышу, тогда как Туктимур укрылся в стране киргизов, в Танну-Ола, где собрал новые силы и внезапно атаковал императорский авангард. В результате своего поражения Ширеки Туктимур и Сарабан переругались. Ширеки убил Туктимура; потом Ширеки и Сарабан начали войну между собой, и после довольно бессвязных маневров Сарабан, взявший в плен Ширеки, сдался Хубилаю, передав ему своего пленника. Хубилай простил Сарабана, но Ширеки сослал на остров. Вскоре принц Номохан был выпущен на свободу (1278). В общем, коалиция развалились из-за бездарности врагов Хубилая.

Но Хайду оставался в состоянии войны с Хубилаем, и он-то, по крайней мере, обладал лидерскими качествами. Властитель Эмеля, Или и Кашгарии, сюзерен Чагатаидов, от владений которых он оставил им одну Трансоксиану, он был настоящим ханом Центральной Азии, противостоящим Хубилаю, хану Дальнего Востока. В 1287 г. он сформировал новую коалицию, в которую вовлек вождей боковых ветвей, происходящих от братьев Чингисхана. В эту коалицию вошли принцы Найан, Сигтур или Сигтур и Кадан. Владения Найана, происходившего или от самого младшего из братьев Чингисхана, Темуге-отчигина, либо от его единокровного брата Бельгутая, находились рядом с Маньчжурией; он был несторианином и, как уверяет Марко Поло, изображал крест на своем знамени, или туге. Сингтур был внуком Хасара, первого брата Чингисхана. Кадан происходил от Хачиуна, второго брата Чингисхана. Их владения также находились рядом с Восточной Монголией и Маньчжурией. Если бы Хайду, ведущему свои войска из Центральной Азии и Западной Монголии, удалось соединиться с войсками Найана, Сингтура и Кадана, собранными на границе с Маньчжурией, положение Хубилая могло бы стать угрожающим.