Среди монгольских вождей, которых Тамерлан победил в этом районе, «Зафар-наме» называет Хизр-Ходжу, наследника династии Чагатаидов, свергнутого с трона узурпатором Камар ад-Дином и бежавшего, как мы знаем из «Тарих-и Рашиди», в самую восточную часть Туркестана (сначала в район Хотана, затем Лобнора), где пытался выкроить себе новое царство, одновременно обращая в ислам последних уйгуров Турфана. Хотя Камар ад-Дин был главным врагом Тамерлана, он без колебаний напал на Хизр-Ходжу, очевидно, из опасения, что дом Чагатая восстановит в Уйгуристане свои силы. Хизр-Ходжа был разбит и бежал в Гоби. Победитель Тамерлан собрал военный съезд в Чалихе, или Джалихе, нынешнем Карашаре, и раздал своим воинам добычу, захваченную у кочевников. «Зафарнаме» четко передает впечатление, что, обосновавшись в сердце Центральной Азии, он казался преемником Чингисхана. В действительности же он разрушил монгольское владычество над Восточным Туркестаном в тот самый момент, когда оно было уничтожено в Китае восшествием на трон династии Мин.
Перед тем как вернуться в Самарканд, Тамерлан послал с Юлдуса вперед своего сына Умар-шейха по дороге из Уч-Фермана (Уч-Турфана) и Кашгара. Нам неизвестно, последовал ли позже он с основной армией тем же маршрутом или вернулся с Юлдуса через Или, Чу и Талас.
Но и в этот раз, несмотря на то что Тамерлан принес разрушения вплоть до сердца Гоби, его главный враг, хан Камар ад-Дин, не был уничтожен. Едва тимуридская армия вернулась в Трансоксиану, Камар ад-Дин восстановил свою власть над Илийской долиной. Тогда, в 1390 г., Тамерлан послал против него армию, которая, выступив из Ташкента, прошла через Иссык-Куль, пересекла Или в Алмалыке, миновала Каратал и по пятам преследовала Камар ад-Дина вплоть до Черного Иртыша, где потеряла его след. Камар ад-Дин исчез на Алтае, «в краю куниц и соболей», и с тех пор о нем ничего не было слышно. Воины Тамерлана развлекались, выжигая каленым железом имя своего повелителя на алтайских соснах, а затем, следуя вдоль берегов Артек-Куля, то есть озера Балхаш, вернулись в Трансоксиану.
Исчезновение узурпатора Камар ад-Дина позволило Чагатаиду Хизр-Ходже получить трон Моголистана. Новый глава дома Дуглат, эмир Худайдад, племянник Камар ад-Дина, всегда бывший «легитимистом», первым призвал Хизр-Ходжу и обеспечил его реставрацию. Новый хан был непоколебимым в вере мусульманином. Мы видели, что, покорив Кара-Ходжу, нынешний Турфан, он силой заставил последних уйгуров перейти в ислам. Эти чувства сближали его с Тамерланом. Между двумя правителями был заключен мир, в результате которого Хизр-Ходжа, около 1397 г., отдал свою дочь в жены Тамерлану – этот брачный союз был ценен тем, что вводил славного выскочку в семью Чингизидов.