Кроме того, имелись суда «Русского общества пароходства и торговли» – в 1889 году их было 67 общим водоизмещением 164 650 тонн¹⁶⁵². Наиболее крупные пароходы были задействованы на линиях вне Черного моря и не было гарантии использования всех транспортных возможностей РОПиТ. Тем не менее 33 парохода и 12 шхун Общества могли перевезти без обоза 1611 офицеров и 48 541 нижних чинов, а с обозом – 1517 офицеров, 23 432 нижних чина, 7373 лошадей и 4899 повозок¹⁶⁵³. Проблема заключалась лишь в одном – значительная часть этих пароходов постоянно находилась в заграничном плавании, трудно было собрать необходимое для десанта количество транспортов в Черном море. Во всяком случае, незаметно для противника¹⁶⁵⁴.

Для лучшего ознакомления с местом проведения планируемой операции с лета 1892 года по предложению командующего Черноморским флотом вице-адмирала Н. В. Копытова на Босфор под видом путешественников стали по очереди командироваться офицеры и адмиралы флота: начальник штаба, старший и младший флагманы, командиры эскадренных броненосцев, мореходных канонерских лодок, минных транспортов, командир крейсера «Память „Меркурия“» – всего три адмирала и 14 штаб-офицеров. Активизировалось и изучение вод и островов Греческого архипелага¹⁶⁵⁵. Войска имели наработанный на маневрах опыт десантирования. Уже в 1890 году результаты учений вызвали удовлетворение императора, в 1891 году перед Черноморским флотом была поставлена задача добиться 12-часовой готовности броненосцев к походу, а перед командованием Одесского округа – сократить срок мобилизации 13-й дивизии, которая должна была войти в авангард десанта – до суток. Оставалось решить технические проблемы, связанные с концентрацией транспортных средств, так как значительная часть судов Доброфлота постоянно находилась в плавании, и обеспечить взаимодействие армейцев и моряков¹⁶⁵⁶.

Последним вопросом в декабре 1894 года начала заниматься Комиссия по обороне черноморского побережья (создана в 1885 году). Общее руководство операцией возлагалось на вице-адмирала Копытова. Численность первого эшелона десанта первоначально была определена в границах от 16 до 23 тыс. чел., артиллерийский запас для него составил 148 орудий (включая 36 тяжелых и 20 облегченных девятидюймовых мортир, 20 тяжелых и 20 легких шестидюймовых пушек, 20 батарейных пушек и 32 57-мм скорострельных береговых орудия)¹⁶⁵⁷. Летом 1895 года состав десанта был окончательно установлен в 51 батальон (13-я и 15-я пехотные дивизии, бригада 14-й пехотной дивизии, 4-я стрелковая бригада, один крепостной артиллерийский и два саперных батальона), четыре сотни казаков, 80 полевых орудий – всего 35 тыс. чел., 1816 лошадей и 432 повозки. Отряд был снабжен всем необходимым для перевозки, высадки на берег вместе с запасом всего необходимого на две-три недели¹⁶⁵⁸.