Суть состояла в том, что в феврале 1938 г. группа учителей, основоположников карельской письменности на фино-латинской основе, была арестована по так называемому «Карельскому делу», расследованием которого занималась специально созданная оперативно-следственная группа УНКВД Калининской области из 30 сотрудников под руководством помощника начальника Управления П. Д. Дергачева и начальника 3-го отдела УНКВД Г. С. Доценко. По некоторым данным, именно в феврале или марте 1938 г. под давлением Доценко застрелился начальник Карельского окружного отдела НКВД П. С. Арсеньев, на место которого и назначили Д. И. Горюнова. В мае, при утверждении на должность, Горюнов вновь доложил о своей семейной ситуации уже лично секретарю Калининского обкома ВКП(б) И. П. Бойцову.
В июле – августе 1938 г. началась вторая волна арестов тверских карел, было репрессировано партийное и советское руководство округа, карелы – сотрудники органов милиции и гособезопасности. По возбужденным в это время уголовном делам проходило около 400 человек, из них было арестовано более 140 карел, многие впоследствии отказались от признательных показаний, полученных в результате психологического и физического давления, избиений.
«Карельское дело» было закрыто по итогам проверки фактов нарушения соцзаконности после издания известного постановления ЦК ВКП(б) и СНК СССР от 17 ноября 1938 г. «Об арестах, прокурорском надзоре и ведении следствия». 4 января 1939 г. состоялось закрытое партийное собрание УГБ УНКВД Калининской области (КО), а в апреле незаконные методы работы были осуждены И. П. Бойцовым на бюро Калининского обкома ВКП(б). В это время, в феврале 1939 г. Карельский национальный округ – эта неудачная, как и все национальные проекты советской власти, попытка «государственности карелов» – был упразднен. Большинство арестованных карел освободили из-под стражи, но этот процесс продолжался и в 1940 г., уже после окончания войны с Финляндией.
Организатор карельского и других «дел» на территории Калининской области – Дергачев, ставший к тому времени врид начальника УНКВД, был арестован в декабре 1938 г., а через год расстрелян. На упоминавшемся закрытом партийном собрании УГБ УНКВД КО в январе 1939 г. прибывший разгребать завалы новый начальник управления Д. С. Токарев говорил: «Руководство нашего управления находилось в руках кучки проходимцев… Есть в области такие районы, где мужское население арестовано поголовно…». На собрании было исключено из партии 11 сотрудников УНКВД, на 16 материалы были направлены для расследования в партком – почти все они уволены с занимаемых должностей. Четырем сотрудникам были объявлены выговоры по партийной линии. Собрание полностью распустило парткомы 3-го и 4-го отделов УНКВД, было принято решение выдвигать на руководящую работу молодые, проверенные, способные кадры.