После похода командовать Оренбургской армией стал Андрей Бакич. Дутов в январе 1920 г. командующим Отдельной Семиреченской армией Б. В. Анненковым был назначен главным начальником Семиреченского края.
Анненковцы встретили дутовцев враждебно, происходили стычки, и даже убийства семей оренбуржцев. На перевале Чулак анненковцы убили около сорока семейств офицеров из оренбургского отряда и беженцев, при этом женщины и девочки от 7 до 18 лет ими были изнасилованы, а затем зарублены. Под давлением атаман Борис Анненков выдал нескольких своих людей, виновных в этом, их зарубили на глазах у оренбургского полка. Один из них, сотник Васильев, был пойман оренбуржцами уже в Китае и погиб голодной смертью в Оренбургском полку.
13 марта генерал Андрей Бакич договорился с китайскими властями и 14 марта 1920 г., в 6–7 утра остатки оренбургской армии — около 10 тысяч человек перешли границу. Ушли в Китай и Дутов (2.04.1920), и Анненков со своими людьми. Китайские власти приказали всем сдать оружие и развернули военный лагерь, установили довольстве — баранину и хлеб, однако питание поступало с перебоями и многие голодали. Часть интернированных решили вернуться обратно — в Россию. Их отпустили, предварительно отслужив напутственные молебны. Иван Еловский, участник «Голодного похода», свидетельствует, что из лагеря ушло больше половины людей.
Дутов готовил поход на территорию Туркестанской советской республики, предполагая использовать собственный вооруженный отряд, отряд генерал-майора А. С. Бакича (находился в Северо-Западном Китае) и получить помощь от антибольшевистского подполья в Семиреченской области). Он вел переговоры с басмачами об одновременном наступлении. В случае првых успехов совместного наступления Оренбургской Отдельной армии и «воинов Аллаха» в игру мог включиться Афганистан.
Ячейки белого подполья были обнаружены в Семиреченской области, в городах Омске, Семипалатинске, Оренбурге, Тюмени. В городах находили дутовские воззвания «К чему стремится атаман Дутов?», «Обращение к большевику», «Слово атамана Дутова к красноармейцам», «Обращение к населению Семиречья», «Народам Туркестана» и т. п.
В июне 1920 г. восстал против Советской власти гарнизон г. Верный (Алма-Ата). В ноябре поднял мятеж 1-й батальон 5-го пограничного полка, был захвачен г. Нарын. И ниточки от всех этих разгромленных подпольных организаций и подавленных мятежей вели в пограничную крепость Суйдун к атаману Дутову.
Дутов смертельно ранен советским агентом Махмудом Ходжамиаровым при покушении (06.02.1921 около 18 часов) и на следующее утро скончался (около 7 часов утра). В операции по уничтожению Дутова участвовала группа из 9 человек, из них 8 уйгуры, руководитель операции Касымхан Чанышев — потомок татарских князей, начальник уездной милиции Джаркента.