В годы Гражданской войны на попечении санатория осталось 25 больных детей, и «все они существовали на деньги и продукты, которые получал Изергин, устраивая приемы в Алупке и посещая больных на дому». Помогали жители кто чем мог — крупой, постным маслом, соленьями. Изергин и оставшийся в санатории персонал — две санитарки и врач — продавали личные вещи, чтобы кормить и лечить больных. Петр Васильевич ездил по окрестным деревням и обменивал их на продукты.

«Тогда с Изергиным приключилась поистине сказочная история: трое бандитов остановили на дороге лошадь врача и приготовились уже ограбить и разделаться с путником, как подоспел четвертый их товарищ: „Ребята, не трогать его, это детский доктор, кладите все обратно“».

В 1920-х гг. Изергину пришлось не раз отстаивать в Москве нужность и полезность санатория. Власти его поддержали и дали средства на открытие школы, остро необходимой санаторию, так как многие дети находились в лечебнице месяцами, а то и годами. Для школы главврач набрал персонал, освоивший две профессии — медика и педагога.

Слава о санатории быстро распространилась по всей стране. Сюда начали приезжать писатели, врачи, ученые, педагоги — М. Горький, Я.С. Маршак, О.Ю. Шмидт, А.Д. Сперанский и другие, навещавшие и поддерживавшие больных родственников и друзей.

В 1928 г. К.И. Чуковский привез в санаторий свою тяжелобольную восьмилетнюю дочку Машу (Муру). Увы, ее не удалось спасти, она умерла в 1931 г. По уверениям знатоков, детский писатель «списал» с Петра Васильевича своего доктора Айболита не только внешность, но и его добрую суть. Во всяком случае, в фильме про Айболита артист О.Н. Ефремов делал грим под Изергина.

В 1931 г. ученые Симеизской астрономической обсерватории дали имя Изергина открытой ими малой планете.

В 1935 г. врачу присвоили звание Героя Труда, а в 1936 г. без защиты диссертации — степень доктора медицинских наук. Тогда же он одним из первых среди медиков был награжден орденом Ленина.

Вскоре после этого в санатории начались проверки и ревизии, не обещавшие ничего доброго. Стресс и нехорошие предчувствия подкосили доктора. 8 октября Петр Васильевич скончался в своем рабочем кабинете от кровоизлияния в мозг. Похоронили Изергина на территории санатория на высоком холме в роще. Проводить главврача в последний путь пришли тысячи людей. После войны его прах перенесли на кладбище в соседний Симеиз.

В 1970-х гг. в лечебнице стали лечить детей с диагнозами остеохондропатия, врожденной патологией опорно-двигательной системы. За год проходили курс лечения и реабилитации до 1000 детей со всей страны.