В июне 1937 года масонов начали выявлять с еще большим пылом. Дело в том, что один из друзей Франко возглавил военизированное научно-исследовательское подразделение, которое стало известно как Государственная делегация по восстановлению документов (ГДВД, или DERD, Delegacion del Estado para la recuperacion de documentes). Тускетсу пришлось отойти от дел и передать архивы. К концу 1938 года ГДВД сообщила, что собрала пять миллионов документов в здании, которое в XVII веке было сиротским приютом. В этом здании в Саламанке коллекция хранится и по сей день. Эта гора бумаги была использована на практике. Франкистские власти очистили государственную службу от «антииспанских» элементов, в том числе масонов. Даже лояльные националисты потеряли работу. Республиканские заключенные, которые, как выяснилось, участвовали в «красном мятеже», могли быть казнены, если их уличали в масонстве.
В марте 1940 года, примерно в то время, когда сеть APIS начала снабжать каудильо разведданными, он создал Специальный трибунал для борьбы с масонством и коммунизмом. Лишь незначительное меньшинство дел, рассматриваемых трибуналом, касалось тех, кого называли коммунистами. Реальной мишенью были масоны. Архив в Саламанке отныне использовался для того, чтобы привлечь всех братьев и привести в Мадрид для суда. В течение следующих десяти лет масонам будет вынесено более двадцати шести тысяч вердиктов.
Судьи, заседавшие в Специальном трибунале для борьбы с масонством, были назначены режимом. Они исходили из того, что все, кто представал перед ними, виновны: оправдательные приговоры были большой редкостью. Максимальный срок наказания составлял тридцать лет тюремного заключения, а минимальный — очень суровые двенадцать лет и один день. Для того чтобы Масон получил смягчение наказания, он должен был полностью отречься от «секты», в идеале перед епископом. Но было чрезвычайно трудно доказать, что это отречение искреннее. В конце концов масонские ритуалы превратили в лжецов всех людей, которые прошли их. Так считали судьи, впитавшие уроки всех антимасоновских пропагандистов со времен аббата Баррюэля. Одним из способов для подозреваемого прибавить доверия к своей исповеди была дача показаний против собственных братьев. Те немногие «счастливчики», которые выдали самую гнусную информацию, могли, таким образом, даже избежать тюрьмы и быть просто уволены с работы в государственном секторе. Поэтому неудивительно, что большинство подсудимых давали те или иные сведения, таким образом добавляя бумаг в картотеку в Саламанке.