Не менее 1000 бойцов хорватского сопротивления были вывезены на территорию Сербии и содержались там, в качестве военнопленных. Из тюрьмы их выпустили лишь в середине 1992 года, когда между Сербией и Хорватией было установлено краткосрочное перемирие.

К концу Битвы за Вуковар ЮНА потеряли (по разным данным) от 110 до 200 бронированных машин, в том числе 50 танков и 3 самолета. В боях погибло более 1100 федеральных солдат (2500 человек было ранено). Хорваты потеряли 1800 человек убитыми и более 2000 ранеными. Во время боев погибло 2000 мирных жителей.

Пиррова победа Югославской армии спровоцировала бегство хорватских жителей с территорий, попавших под федеральный контроль. В некоторых источниках содержится информация о том, что после падения Вуковара в Хорватию перебралось не менее 30 тыс. человек (3). Как бы там ни было, ожесточение, охватившее бойцов ЮНА и защитников города, привело к тому, что военные преступления на территории Югославии стали обыденностью, а этнические чистки превратились в инструмент устрашения, к которому стали прибегать все стороны, участвующие в конфликте.

Вина за пиррову победа при Вуковаре целиком и полностью лежит на высшем командном составе ЮНА. Вместо того, чтобы прислушаться к советам командиров низшего и среднего звена, югославские военачальники воевали по устаревшим схемам, которые приводили к потере людей и техники. Огромные потери в танках связаны с тем, что командование ЮНА отказалось от использования современных тактических схем, опробованных частями Советской армии в Афганской войне 1979–1989 года. Справедливости ради стоит отметить, что во время штурма Грозного в 1994 году российская армия наступила на те же самые грабли, полностью проигнорировав болезненный Вуковарский опыт.

Югославская армия проявила полную беспечность при планировании саперных и инженерных операций. Федералы отказались от подрывов вражеских туннелей и жилых блоков, занятых врагом, в результат борьбу со снайперами и подкреплениями осуществляли танки и деморализованная югославская пехота.

ЮНА, несмотря на огромное количество осветительных боерпипасов и наличие штурмвой авиации, способной совершать налёты в темное время суток, ночные бои не вела. Вероятно, отказ от боевых действий ночью был связан с плохой подготовкой личного состава и отсутствием на передовой опытных специалистов.

Слабым местом хорватов была частичная изоляция защитных узлов. ЮНА могла бы просто окружать защитников города, запирая их в котлах, отрезая от снабжения и боеприпасов. Оказавшись в окружении, хорваты бы быстро сдались ЮНА поскольку не имели достаточного количества боеприпасов и из-за отсутствия тяжелого вооружения не могли рассчитывать на прорыв. Вместо этого федералы уничтожали каждый элемент обороны, затрачивая на «уверенное продвижение» значительное количество людских и материальных ресурсов.