23 сентября подразделения ЮНА атаковали позиции хорватов в районе деревни Виталина и Бргат, расположенных к востоку от Дубровника. 25 сентября побережье Дубровника было блокировано малочисленным Югославским флотом. 26 сентября Штаб Югославской армии переименовал Оперативную Группу «Восточная Герцеговина» во 2-ую оперативную группу, которая стала подчиняться непосредственно федеральному министру обороны, после чего обе стороны конфликта стали готовиться к полноценной осаде Дубровника.

Согласно плану Штаба югославской армии 2-я оперативная группа (в составе 2-го Титоградского корпуса и 9-ой Боко-Которской дивизии, усиленной 5-й и 472-й моторизированной бригадами) должна была отрезать Дубровник от остальной Хорватии, подавить сопротивление его защитников и взять город штурмом. Поддержку 2-ой оперативной группе оказывали 16-ый пограничный полк, 107-я артиллерийская береговая группа, а также подразделения Территориальной обороны из Херцег-Нови, Тивата, Котора, Будвы, Бара, Мойковаца, Биело Поле и Требине. Командиром 9-ой Боко-Которской дивизии был вице-адмирал Миодраг Йокич, заменивший адмирала Крсто Джуровича (умершего при подозрительных обстоятельствах за несколько часов до начала операции). Согласно версии генерал-майора Нойко Мариновича, командира 472-й моторизированной бригады (17-го сентября он перешел на сторону хорватов), адмирал не умер, а был убит, поскольку не одобрял саму концепцию осады Дубровника.

Всего в операции против Дубровника должно было участвовать не менее 7 000 югославских солдат и офицеров.

В тот же день министр внутренних дел Черногории издал секретный приказ о полной мобилизации Специального подразделения Черногорской полиции, бойцы которого должны были действовать совместно с югославскими войсками.

В начале боевых действий их было всего 450 человек, при этом хоть какой-то боевой опыт имели не более 50 бойцов. Вооружение у защитников было устаревшим, поскольку, начиная с 1972 года (когда Дубровник был провозглашен полностью демилитаризованной зоной) в этой области не было ни одного склада оружия, предназначенного для территориальной обороны. Все легкое вооружение хорватов было захвачено ими на раннем этапе конфликта во время битвы за Казармы (в основном оружие было добыто на складах острова Корчула 26 сентября 1991 года).

В конце сентября в Дубровник вошли небольшие подразделения хорватской полиции и хорватских сил самообороны, после чего суммарное число защитников города увеличилось до 600 человек. Не стоит забывать и о Эскадре военных кораблей Дубровника, которая состояла из 23 судов (преимущественно катеров и вельботов с пулеметным вооружением) и 117 добровольцев.