Немедленно из него выкатились бронетранспортеры и «мерседес», на котором к старому аэровокзалу направился командир группы освобождения заложников, опытный и отважный воин подполковник Ионатан Нетаниягу. Он застрелил первого же угандийского часового, который попытался их остановить, и десантники ворвались в аэровокзал. Заложники спали на полу. Их охраняли четыре террориста, которые стояли в разных концах зала с автоматами в руках и были немедленно убиты десантниками. Заложникам на иврите приказали встать и следовать на погрузку. Несмотря на неожиданность событий и охвативший их восторг, они вполне дисциплинированно погрузились в самолет.
Следом за первым приземлились и остальные самолеты авиагруппы. Со второго выгрузилось еще одно подразделение с бронетехникой. Оно вступило в бой с охраной аэропорта и террористами. И если террористов уничтожали бескомпромиссно, то по угандийским солдатам вели огонь, только если они оказывали вооруженное сопротивление. Кроме охраны, десантникам пришлось вести бой с подразделением, которое прибыло из столицы Уганды на подмогу. Однако эти солдаты даже не успели сойти с машин и были также уничтожены.
Всего в ходе операции израильские коммандос уничтожили 13 террористов и еще 45 угандийских солдат. Кроме того, они взорвали 8 угандийских истребителей МиГ, стоявших на взлетной полосе, и, таким образом, исключили возможность перехвата оперативной группы на обратном пути. Были уничтожены также оба контрольных радарных центра.
Однако и израильтяне понесли потери. Трое раненых, двое погибших, и в том числе — прекрасный офицер, мужественный и доблестный командир подполковник Ионатан Нетаниягу. Все раненые были помещены в специальный госпитальный самолет. Первым взлетел, через 57 минут после начала наземной операции, самолет с заложниками, а через 42 минуты после него — и последний, который нес десантников и командира всей операции «Энтеббе» генерала Дана Шомрона.
Таким образом, она продолжалась, если не считать полетного времени, немногим больше полутора часов. Эта операция продемонстрировала всему миру решимость и готовность Израиля бороться против терроризма на любом материке, не считаясь с расстоянием и опасностями, особенно если дело связано с освобождением израильских граждан или является возмездием за террор. Солдаты Израиля, его разведчики, летчики и десантники совершили одну из самых фантастических по замыслу и исполнению боевых операций во всей военной истории.