В это же время в Ливане произошло трагическое событие, еще более дестабилизировавшее обстановку и надолго определившее неблагоприятную ситуацию и непрерывную вооруженную борьбу общин и конфессий этой небольшой страны. Незадолго перед этим президентом Ливана был избран христианин Башир Джумайель, весьма авторитетный лидер, человек мужественный и волевой, ярый противник раскола страны и сирийского присутствия. Но он пробыл в звании президента только две недели, не успев даже принять эту должность от своего предшественника. 14 сентября 1982 года Башир и весь его штаб были подорваны мощным зарядом, и почти все погибли под обломками здания, где они находились. Христианская община Ливана этим террористическим актом была обезглавлена. Озлобление ее членов достигло предела, обвинения в устройстве взрыва все чаще раздавались по адресу палестинцев, которым христиане были намерены отомстить.

В этой обстановке, с разрешения премьера Менахема Бегина, министр обороны Ариэль Шарон приказал израильским частям войти в Западный Бейрут и обеспечить там порядок и безопасность. Приказ был выполнен, израильтяне полностью контролировали город, кроме палестинских лагерей Сабра и Шатила, состоящих из нескольких тысяч домов. Эти лагеря, в сущности, были городскими районами, и, по данным разведки, вместе с мирным населением там укрывались и бойцы ООП, которые не ушли с Арафатом.

Не желая иметь с ними дело, что неминуемо сулило боевые столкновения и потери, израильское командование предложило взять контроль над этими лагерями христианскому руководству. И вечером 16 сентября формирования христиан-фалангистов вступили в Сабру и Шатилу. Там немедленно разгорелись бои. Но христиане не просто вылавливали вооруженных палестинцев. Прошло всего два дня после гибели президента Башира и многих других лидеров христианской общины, в чем фалангисты были склонны обвинять в первую очередь палестинцев. Поэтому христиане, и прежде всего — подразделения фалангистов, перешли к поголовному избиению всего населения этих палестинских лагерей, мстя, таким образом, за гибель своего вождя.

Когда израильское командование узнало об этой резне, то уже на следующий день командующий Северным фронтом генерал-майор Амир Дрори потребовал у фалангистского руководства вывести свои отряды из Сабры и Шатилы, и они покинули эти лагеря 18 сентября, оставляя за собой многие тысячи трупов.

Международное сообщество с негодованием отозвалось на резню, учиненную фалангистами. Израильтян обвиняли в попустительстве, а то и в пособничестве убийцам и насильникам. Под напором общественного мнения в самом Израиле Менахем Бегин был вынужден сместить с занимаемых постов министра обороны Ариэля Шарона, начальника военной разведки генерала Иегошуа Саги и командующего израильскими частями, дислоцированными в Бейруте, бригадного генерала Амоса Ярона. Израильские войска были выведены из столицы Ливана.