Власти не препятствовали возникновению новых церквей. В октябре 1921 г. на I Всеукраинском православном церковном соборе, организованном Союзом православных приходов, была создана Украинская автокефальная православная церковь (УАПЦ), противостоявшая Православной российской церкви и использовавшая украинский язык в богослужении. Церковь возглавил В. Липковский, одним из ее организаторов и лидеров был видный деятель УНР В. Чеховский. По данным ГПУ к 1925 г. у РПЦ («тихоновцев») на Украине было 6453 прихода с более 4,8 миллионов прихожан, у обновленцев — 1497 приходов с 921 тыс. прихожан, а у УАПЦ 989 приходов с 680 тыс. прихожан.

КП(б)У имела сильное представительство в РКП(б). Из 25–27 членов ЦК, избранных в 1921–1922 гг., четверо были с Украины. Это позволяло успешно отстаивать интересы республики в конфликтах с центральными ведомствами.

В 1923 г. разгорелся конфликт между заместителем председателя Госплана Г. Пятаковым и председателем правительства Украины В. Чубарем. Союзный центр в лице Пятакова стремился изъять из подчинения Украины крупнейшие тресты — «Химуголь», «Южмаштрест», «Текстильтрест», «Сахаротрест», что оставляло бы совнархозу Украины только незначительную часть предприятий с 5 % рабочих. Эта атака Пятакова была отчасти продолжением его прежней политики унитаризма и нынешнего курса концентрации ресурсов на нужды скорейшей индустриализации, которая привела Пятакова в ряды левой оппозиции. Региональные лидеры в этих условиях поддержали противников левых, что способствовало и сохранению влияния региональных кланов бюрократии в период НЭП.

Продолжалась и борьба среди украинских группировок. В конце гражданской войны преобладание получила восточная во главе с Э. Квирингом (Артем погиб 24 июля 1921 г. при испытании аэровагона). Квиринг в качестве первого секретаря ЦК КП(б)У боролся с кон-федералистом и «троцкистом» Раковским, который в 1923 г. потерял пост председателя Совнаркома и был переведен на дипломатическую работу. В апреле 1925 г. генеральным секретарем ЦК КП(б)У стал присланный из Москвы Л. Каганович, который активнее проводил политику украинизации, чем «провосточный» Квиринг.

В ходе уточнения границ между республиками («размежевания») украинское руководство в 1924 г. выдвинуло претензии на часть Воронежской, Курской губерний и Северо-Кавказского края, но Украинская ССР получила существенно меньшие территории, поделившись к тому же с РСФСР и Белоруссией. Еще в 1920 г. в состав УССР был включен весь Донбасс (а не только его часть, входившая в Екатеринослав-скую губернию). Это было вызвано мотивами улучшения управления промышленностью. Однако затем выяснилось, что часть предприятий Донбасса экономически тяготеют к Ростову и к азово-черноморскому побережью РСФСР. В 1925–1926 г. после длительного обсуждения в советских органах города Таганрог, Шахты и прилегающие к ним территории отошли к РСФСР. Одновременно на севере Украины город Путивль и ряд других населенных пунктов, тяготеющих к Украине в культурном отношении, отошли к УССР. 12 октября 1924 г., после Татарбунарского восстания в Бессарабии, на территории Украины была создана также Молдавская АССР, которая в перспективе должна была воссоединиться с Бессарабией. Молдаване составляли менее трети ее населения.