Жан Гастон, несмотря на свою лень, в начале своего правления провел несколько полезных либеральных реформ. Первое, что он сделал, – это упразднил религиозное правительство своего отца, изгнал священнослужителей из дворца Питти и отправил их туда, где им положено быть: в церкви и монастыри. Затем в честь своего восшествия на престол он объявил всеобщую амнистию всем заключенным без исключения, запретил публичные смертные казни, отменил антисемитские законы и законы против проституток, которые ввел Козимо III. Новый великий герцог уменьшил власть церковников и обложил их налогами и, наоборот, понизил налоги торговцам и ремесленникам. Он уволил шпионов своего отца, тем самым сэкономил на их зарплате, и отправил нищих на общественные работы. В университетах Пизы и Флоренции Жан Гастон запретил преподавание философии Аристотеля, расширил образовательную программу, позволил использовать работы Галилео Галилея и Никколо Коперника, разрешил создание новых кафедр, таких как теоретическая хирургия, химия, алгебра, нанял новых профессоров и начал строительство астрономической обсерватории.

В 1730 году Жан Гастон помог взойти на Папский престол кардиналу из благородного флорентийского рода Лоренцо Корсини. Когда тот был коронован как понтифик под именем Климент XII, великий герцог Тосканский попросил его об ответной услуге – разрешить похоронить Галилео Галилея непосредственно в базилике Санта-Кроче. Климент XII не смог отказать своему благодетелю и дал разрешение. Так Жан Гастон организовал пышные похороны Галилео Галилея в Санта-Кроче, напротив могилы Микеланджело Буонарроти. Он также заказал его памятник придворному скульптору Медичи Джованни Баттиста Фоджини – тому, что изготовил памятник Святому Франциску Ксаверию в Гоа по заказу Козимо III. На работу над монументом Галилея ушло семь лет, и работа была закончена в 1737 году, незадолго до смерти герцога.

На проведение всех этих реформ, которые Жан Гастон с энтузиазмом начал вводить, требовалось время. Но уже в начале его правления Флоренция начала потихоньку оживать и как-то возрождаться. Флорентийцы, которые боялись и ненавидели предыдущего великого герцога, прониклись большой симпатией к новому. Жан Гастон старался исправить то, что еще можно было исправить после 53 лет деспотичного правления Козимо III. Жители Флоренции давно знали о том, какой он ведет образ жизни, но после всех проведенных реформ перестали его осуждать. В городе начала оживать торговля, вновь открылись когда-то закрытые из-за непосильных налогов мастерские и магазины. Сельское хозяйство тоже постепенно возрождалось, крестьяне начали распахивать и засеивать пустоши. Были отремонтированы некоторые дома и мостовая, поросшая сорняками в эпоху Козимо III. Вновь организовывали праздники, которые отменил Козимо III: карнавалы, кортеж волхвов, гонки на колесницах, футбольные матчи, красивые шествия и рыцарские турниры на площади Санта-Кроче. Жан Гастон упразднил все те лишние религиозные праздники, которые ввели его отец и бабушка Виктория делла Ровере. Герцог увлекался не только изучением иностранных языков, но и итальянского – тогда это все еще был тосканский диалект. Поэтому он возродил Академию делла Круска, которая зачахла в годы правления его отца.