Отношения между двумя командирами были явно натянутыми. Несомненно, Спиридов был старше по званию, но Эльфинстон утверждал, что императрица якобы письменно заверила его в полной независимости от Спиридова и подчиняться он должен только графу Орлову. Если же потребуется объединить две эскадры, то Спиридов должен подчиняться ему, а не наоборот. Теперь, когда Спиридов, по мнению Эльфинстона, не сумел поддержать его должным образом, он яростно настаивал на этом. По предложению графа Федора Орлова, брата командующего, было решено, что обе эскадры вернутся в Наваринскую бухту и там объединят свои корабли, так что и Спиридов, и Эльфинстон будут служить под началом признанного командира. Соответственно, 13 июня, как только Эльфинстон вернулся от Негропонта, обе эскадры вышли из Порто-Рафти и взяли курс на Цериго.

Граф Орлов не сумел сохранить свои позиции в Наварине надолго. Подошли многократно превосходящие турецкие наземные силы, и в конце концов он был вынужден погрузить свои войска на корабли и 3 июня покинуть крепость. 7-го и корабли отошли от берега. Одновременно граф Орлов послал адмирала Елманова на «Надежде благополучия» 32 с кораблями «Венера», «Соломбала» и «Сатурн», чтобы отвезти больных в порт Маон, а сам на «Трех Иерархов» 66 в компании с бомбардирским кораблем «Гром» направился на соединение с эскадрами Спиридова и Эльфинстона. В тот день в районе острова Сапиенца он встретил корабль «Ростислав» 66, последний из линкоров Спиридова. Этот корабль вышел из Лиссабона в порт Маон 2 января, но штормом его отнесло до самой Сардинии. Вернувшись в Маон, он не нашел там Спиридова, проследовал в Геную и Ливорно, а потом к Витуло на Майне¹⁶.

Направляясь к Архипелагу, Орлов встретил двух своих подчиненных 22 июня в районе Бел-Поуло¹⁷. Объединенный флот из девяти линкоров и трех фрегатов бросил якоря у Пароса 27-го, чтобы пополнить запасы воды. Там русские узнали, что турецкий флот находится между Хиосом и материком – Анатолией. 1 июля Орлов приказал поднять якоря, и корабли медленно двинулись в этом направлении, преодолевая северо-восточный ветер. 4-го в пять часов пополудни с «Ростислава», посланного вперед на разведку, подали сигнал, что противник обнаружен. Утром 5 июля 1770 года русский флот обогнул с севера остров Хиос. Перед ним оказался турецкий флот, стоящий на якорях с подветренной стороны.

Два турецких линкора ушли в Митилену накануне вечером, и теперь флот состоял из 16 линкоров, а также фрегатов и небольших кораблей¹⁸. Все корабли стояли на якорях близко к материковому берегу, к северу от гавани Чесмы. Тяжелые корабли стояли в две линии, протянувшиеся, если считать грубо, с севера на юг: 10 кораблей с 70—100 орудиями в передней линии, остальные – во второй линии, но они были расположены так, чтобы иметь возможность вести огонь через промежутки в первой линии. Галеры и небольшие суда находились за двумя линиями. Всего у турок было не менее 20 линкоров и фрегатов с 1300 орудиями, против 9 кораблей и 3 фрегатов с 710 орудиями у русских. Русские расположили свои корабли в боевой порядок следующим образом¹⁹.