Тем временем положение в Гибралтаре изменило заявление императора Марокко, что «Мешуда» теперь его собственность. Оно было сделано в конце августа, и в начале сентября на корабль прибыла команда. Тот факт, что один из новых офицеров был на самом деле капитаном триполийского брига, сделал передачу собственности сомнительной, но сертификат императора Марокко от 17 сентября невозможно было игнорировать. 27-го американский консул покорно выдал для корабля гарантию безопасного прохода, «за исключением блокированных портов». Тем не менее «Мешуда» оставалась в Гибралтаре еще шесть месяцев.
В Малаге «Энтерпрайз» был отослан назад к Моррису и «Джону Адамсу», чтобы доставить фока-рей и другое оборудование и запасы для «Констеллейшн». Он вернулся 10 декабря и привез приказ о возвращении в Америку для «Чесапика» и «Констеллейшн». «Адамс» тоже должен был вернуться, если без него можно будет обойтись. Моррису предстояло поднять свой флаг на «Нью-Йорке» или «Джоне Адамсе». Учитывая все сказанное, «Констеллейшн» ушел из Малаги 15 декабря. Он вышел из Гибралтара к родным берегам 29-го, но почти сразу вернулся из-за сильного встречного ветра и оставался в Гибралтаре до 26 января, когда ему наконец удалось начать плавание. Он прибыл в Вашингтон 15 марта.
Только после подхода «Джона Адамса» к Мальте 4 января 1803 года Моррис получил приказы. Он посчитал «Чесапик» непригодным для совершения столь длительного плавания в зимний период. Он ушел из Ливорно 4 ноября с Кэткартом, бывшим консулом в Триполи, на борту, который должен был выступить в роли переговорщика, и прибыл на Мальту 20-го. Бушприт «Чесапика» был в плачевном состоянии и требовал большого ремонта. После его выполнения он 25 декабря ушел в Сиракузы за продовольствием и вернулся 4 января. У Мальты его ждали «Джон Адамс», «Нью-Йорк» и «Энтерпрайз», так что теперь вся эскадра Морриса была в сборе, за исключением «Адамса», который все еще оставался в Гибралтаре. «Нью-Йорк» 21 ноября был в Алжире и ушел на ремонт в порт Маон, где посчитали необходимым произвести ремонт фок-мачты и проконопатить корпус и палубу. В Малагу корабль пришел 29 декабря.
Впоследствии Морриса винили за то, что он прибыл в Триполи с большой задержкой. Однако, согласно его собственному рассказу, только 25 февраля был закончен ремонт на «Джоне Адамсе», а доставленные на нем запасы распределены по другим кораблям. Эскадра вышла в море 30 января. Но тем временем «Энтерпрайз» совершил несколько неудачный захват. Императорская полякра «Паолина» была загружена для Триполи на Мальте, и Моррис направил «Энтерпрайз» 15-го, чтобы тот дождался ее ухода. Захват был осуществлен 17-го, и на следующий день два корабля вернулись. К сожалению, часть груза принадлежала тунисским подданным, и это вызвало осложнения.