В вечер сражения Тахир-паша посетил Кодрингтона на борту «Азии», а на следующий день, когда его флаг был поднят на одном из уцелевших корветов, «Дартмут» доставил его на борт для второй беседы. Кодрингтон пожаловался, что у него плохой переводчик, но обнаружил, когда визитер уже собирался уходить, что тот, вероятнее всего, понял многое из того, что британские офицеры говорили между собой. Поскольку Тахир не присутствовал на конференции 25 сентября, когда другие командиры выразили согласие приостановить операции, он не был обвинен в нарушении обещания, и оказанный ему прием был относительно дружелюбным. А так как он объявил, что не общается с Ибрагимом, несомненно, склонил чашу весов в его пользу. Тахир-паша взялся доставить письмо своему главнокомандующему и по собственной инициативе обещал, что его корабли не будут предпринимать никаких враждебных действий.
Потери в живой силе у союзников составили 182 человека убитыми и 489 ранеными, соответственно 43 и 144 у французов, 80 и 206 у британцев, 59 и 139 у русских. Самые тяжелые потери понесли три флагмана: на «Азове» они составили 91 человек убитыми и ранеными, на «Азии» – 76, на «Сирене» – 63. Потери турок и египтян точно неизвестны, но, по разным сведениям, они составили от 3 до 4 тысяч человек. Многие важные корабли союзного флота были сильно повреждены – слишком сильно, чтобы их можно было отремонтировать собственными силами. Французы могли послать свои корабли в Тулон, но у русских не было своей базы в пределах досягаемости, и им пришлось идти на ремонт на Мальту. Поврежденный флот Кодрингтона тоже направился туда, но только для принятия временных мер, необходимых для обеспечения их перехода в Англию.
Французский линкор «Прованс», все еще находившийся под временным парусным вооружением, присоединился к своей эскадре в день после окончания сражения, а русский корвет «Гремящий» прибыл 24-го. «Роза» ушла в Смирну 21-го, «Талбот» и «Бриск» – на Мальту 23-го, а «Дартмут» в тот же день отправился в Анкону с депешами Кодрингтона. Остальной флот вышел в море 25-го. Де Риньи с «Тридентом»62, «Армидом» и «Альционом» в сопровождении британского «Кэмбриана» и русского «Константина» направились в Смирну. «Глазго» ушел к Сире, чтобы следить за деятельностью греческих корсаров. Кодрингтон с остальной эскадрой, а также французские корабли «Бреслау» и «Дафна» прибыли на Мальту 3 ноября. Четыре русских линкора с двумя фрегатами и корветом прибыли туда же 8-го. «Елена» отправилась с депешами в Анкону, но туда не пришла. Непогода заставила ее высадить курьера в Отранто и провести несколько дней на Корфу, прежде чем идти на Мальту, куда она прибыла 1 декабря. «Дартмут» прибыл на Мальту из Анконы 28 ноября. Остальные французские корабли пошли прямо в Тулон.