Глава польской военной миссии руководствовался инструкциями генерала Галлера, предусматривавшими разрешение политических противоречий между польским политическим руководством и представителями коалиции, стремился к примирению сторон. С этой целью 23 марта 1919 г. был созван съезд ПВК и ПНК во Владивостоке, где ПВК сохранил за собой вопросы политического руководства войсками, а ПНК – вопросы работы с населением. Съезд высказался за назначение польским правительством своего представителя в Сибири – «высокого комиссара»[1872]. Поскольку позиции ПВК среди военных ослабли, то комитет решил сосредоточиться на деятельности среди гражданского населения. В Омске в марте 1919 г. по инициативе ПВК был создан Польский железнодорожный эмиграционный союз, регистрировавший желающих выехать в Польшу железнодорожников[1873].

ПВК занялся подготовкой к эвакуации из Сибири инвалидов, а также польских беженцев. Было принято решение организовать отправку семей беженцев и военных, вдов, детей и инвалидов морским путем. С этой целью при комитете был создан гражданский отдел. 28 января 1919 г. делегат ПВК Тшнадель выступил с заявлением о начале регистрации в Томске польских беженцев, а также тех поляков, которые желали вернуться в Польшу. Регистрация должна была проходить в отеле «Европа» с 29 января по 6 февраля 1919 г. ПВК обратился к союзникам с просьбой предоставить вагоны для эвакуации 50 тыс. беженцев партиями через Дальний Восток[1874].

Хотя ПВК сыграл большую роль в формировании 5-й польской дивизии, отношения между ПВК и военными ухудшились. После завершения формирования 5-й дивизии в 1919 г. военные потребовали роспуска комитета и вступления его сотрудников в ряды дивизии, в то время как представители ПВК выступали за скорый вывод польских войск из Сибири, против привлечения польских воинских частей к охране железной дороги. Командование польских войск обвиняло ПВК во вторжении в сферу деятельности военных. По приказу Чумы от 27 мая 1919 г. комитет был лишен полномочий для решения политических вопросов. Данное решение ухудшило отношения между польскими и чехословацкими военными, поскольку благодаря стараниям ПВК эти отношения были вполне доброжелательными[1875].

Весной 1919 г., когда армии Колчака перешли в наступление, русское командование стало добиваться отправки на фронт 5-й польской дивизии. Колчак обращался по этому вопросу к полковнику Чуме и майору Окуличу-Козарину, но получил отрицательный ответ: оба офицера считали, что не могут принять такое решение по причине отсутствия приказов военных властей в Польше. Руководство ПВК также настаивало на сохранении нейтралитета и скорейшем выводе войск в Польшу[1876].