Важной исторической вехой в жизни госпиталя является присвоение ему в 1968 г. статуса клинического учреждения. Современная материально-техническая и клиническая база госпиталя позволяет его сотрудникам проводить на высоком уровне не только лечебно-профилактическую работу, но и учебно-педагогическую и научно-исследовательскую деятельность. База госпиталя интенсивно используется для усовершенствования военно-медицинских специалистов округа и подготовки слушателей Военно-медицинской академии, с которой на протяжении всей истории поддерживается тесное творческое сотрудничество.

В 1985 г. за достигнутые успехи в медицинском обслуживании воинов и в связи с 40-й годовщиной Победы госпиталь награжден орденом Трудового Красного Знамени.

В 1991 г. при окружном госпитале сформирован медицинский отряд специального назначения, предназначенный для оказания медицинской помощи в чрезвычайных ситуациях. Личный состав отряда и специалисты госпиталя успешно выполняли боевые задачи по медицинскому обеспечению войск в зоне локальных вооруженных конфликтов, за что более 100 человек отмечены высокими правительственными наградами.

Интенсивное совершенствование организационно-штатной структуры госпиталя, расширение и укрепление его лечебно-материальной базы начинается с 1976 г., когда госпиталь перевели на штат с численностью 1700 коек. Дополнительно развернули отделения гнойной хирургии, второе урологическое, неотложной терапии и пульмонологическое. Создание этих отделений положительно отразилось на результатах лечения больных со сложной патологией.

В целях более эффективного лечения больных, нуждающихся в неотложных терапевтических мероприятиях, в 1977 г. при 15-м медицинском отделении неотложной терапии была развернута палата реанимации и интенсивной терапии с круглосуточным дежурством медицинских сестер. С 1980 г. все кардиологические отделения размещаются в отдельном трехэтажном здании на 235 коек.

Специализированная кардиологическая помощь окончательно оформилась в 1992 г., когда был создан штатный кардиологический центр в составе сектора интенсивной терапии и реанимации и трех специализированных отделений.

В июле 1982 г. количество лечебных отделений увеличилось с 25 до 33 за счет разделения 90-100 коечных отделений на два, что позволило улучшить в них организацию лечебно-диагностического процесса. Были введены в штат операционное отделение, центральная стерилизационная, отделение гипербарической оксигенации, эндокринологическое отделение и кабинет иглорефлексотерапии.

С 1987 г. в составе лабораторного отделения функционирует лаборатория инфекционной иммуннологии, позволившая активно заняться вопросами диагностики и профилактики ВИЧ-инфекции.