В восточной части острова создали специальное предприятие по переработке лекарственных растений. Со временем на его месте вырос фармацевтический завод. Не зря рядом с Ботаническим садом еще в 1919 году открылся первый в стране Химико-фармацевтический институт.
В 1823 году последовало высочайшее повеление изменить устройство Аптекарского сада, перестроить и улучшить здания, «приобретать отныне покупкою живые и сухие растения и семена» и, наконец, переименовать Аптечный сад в Императорский ботанический сад (ныне Ботанический музей Академии наук РФ). На территории сада находится один из старейших музеев города и единственный в России – Ботанический музей Российской академии наук.
По аллеям сада любили прогуливаться не только члены императорской фамилии, но и многие выдающиеся деятели русской культуры.
Его тенистые аллеи и поляны любил поэт Александр Блок, ведь он жил рядом, и именно здесь рождались замыслы многих его произведений.
Известно, что Аптекарский огород превратился в благоустроенный сад уже в 30-х годах XVIII века.
Но в те годы он получил мировую известность совсем не благодаря своей «превеликости», то есть размеру. В XVIII веке здесь проходила передовая войны с учением Линнея.
Сегодня трудно представить, что тихие аллеи и оранжереи Ботанического сада были когда-то линией фронта. Правда, научного. И страсти здесь кипели не шуточные.
Главный садовник огорода Иоганн Сигизбек считал шведского учёного, врача и натуралиста Карла Линнея – автора знаменитой классификационной системы, опасным развратником. Развратность Линнея заключалась в пропаганде учения о тычинках и пестиках. Сигизбек резко выступал против определения пола у растений, против описанного ботаниками процесса оплодотворения, считая, что в растительном царстве исключена подобная безнравственность. Система Линнея, утверждал Сигизбек, оскорбляет нравственность.
Линней ответил на выпады Сигизбека довольно своеобразно. Однажды весной в Петербургский ботанический сад пришла посылка от Линнея из старинного шведского университетского города Упсалы. Мешочек семян с сопроводительной надписью: «Cuculus ignotus – “кукушка неблагодарная”» – принесли Сигизбеку. Тот, приняв надпись за латинское название нового вида, велел высеять семена в саду.
К великому удивлению, а затем и негодованию директора, из них выросла… сигизбекия восточная!
Линней нарёк именем Иоганна Георга Сигизбека полученное им из Сибири невзрачное полусорное растение из семейства сложноцветных – сигизбекию восточную (Siegesbeckia orientalis). Язвительный намёк Линнея попал точно в цель.