В уже упоминавшейся книге о Кронштадтском мятеже В.Я. Крестьянинов приводит ужасающие подробности расправ, особо отмечая при этом, что ни один из арестованных мятежниками коммунистов расстрелян не был.

По воспоминаниям старожилов, вечером 18 марта 1921 г. пленные были построены на Усть-Рогатке в одну шеренгу и каждый второй застрелен на месте. Всего в ночь с 18-го на 19-е расстреляли около 400 человек. Пленных мятежников, которых не расстреляли сразу, заставили собирать трупы на льду и на улицах города. После этого начали заседать чрезвычайные тройки, и расстрелы стали проводиться более планомерно. Расстреливали не только в Кронштадте, но и под

Ораниенбаумом, в Мартышкине, Сестрорецке, Царском Селе и Гатчине. Уничтожались не только те, кто участвовал в восстании с оружием в руках. Настоятель крепостного собора Владимирской Божьей Матери протоиерей отец Иоанн Невдачин арестован 18 марта и 21-го решением чрезвычайной тройки расстрелян. Специальное следственное дело завели по Морскому собору. Во время восстания 5 марта вооруженные матросы установили под куполом собора наблюдательный пункт и провели туда телефон. После взятия Кронштадта арестовали председателя церковного совета И.О. Деркачен-ко, священников Н.И. Ложкина и В.М. Братолюбова, сторожей А.В. Драгунова и А.И. Михненок, С.М. Угрюмова и церковного старосту Н.К. Исакова.

Следователь провел расследование в течение одного дня и предложил священников расстрелять, так как они «по своему положению не пытались даже протестовать против обращения церкви в орудие военной борьбы, не указывали на это своим прихожанам и тем самым проявили себя сторонниками и пособниками мятежников». Остальных предлагалось «подвергнуть заключению в концентрационный лагерь сроком на три года». По решению чрезвычайной тройки, священников и Деркаченко расстреляли, а сторожа и староста получили по пять лет работ в лагерях.

Расстрельные приговоры приводились в исполнение или в день вынесения, или в ближайшие дни. Массовые захоронения расстрелянных кронштадтцев имеются в Детском Селе и других местах. В справке КГБ указано количество приговоренных к смерти только по сентябрь 1921 г. В ноябре 1921-го, в честь годовщины Октябрьской революции, участникам Кронштадтского восстания объявили амнистию. Но к этому времени кого могли, уже расстреляли. А из тех, кто ушел в Финляндию, подвергались амнистии только рядовые участники, а не «главари», причем решать, кто «главарь», а кто рядовой, должен был следователь ВЧК. Некоторые активные деятели восстания вернулись почти сразу, чтобы продолжать борьбу. Так, членов Ревкома А.Н. Архипова, В.А. Яковенко, Г. П.Тукини и других задержали на территории РСФСР и репрессировали.