Начало деятельности Государственной Думы, разумеется, не могло не отразиться и на составлении духовным ведомством своей финансовой сметы. В материалах на 1908 г. впервые появляется, помимо «перечня главных подразделений сметы расходов» («Перечень А»), «перечень вошедших в смету Святейшего Синода на 1909 г. расходов, с разделением их на категории по характеру сметных оснований» («Перечень Б»). Появление «Перечня Б» нельзя считать случайностью: в нем были предусмотрены разделы, появление которых напрямую связывалось с деятельностью Государственной Думы и реформированного Государственного Совета. В первом разделе, так до 1917 г. никогда и не заполненном, предполагалось помещать сведения о кредитах, не подлежавших обсуждению законодательных учреждений, и кредитах, не подлежавшие сокращению. Во втором — кредиты, вносившиеся в смету на основании действовавших законов, положений, штатов, расписаний, а также Высочайших повелений, последовавших в порядке верховного управления и подлежавших изменению в порядке законодательной отмены тех постановлений, на которых они основаны. Наконец, в третьем разделе помещались сведения о кредитах, подлежавших свободному обсуждению в законодательных учреждениях. Абсолютное большинство кредитов всегда проходило по второму разделу, что не позволяло оппозиционно по отношению к Церкви настроенным законодателям по какой-либо причине урезать (или, лучше сказать, пытаться урезать) финансирование духовного ведомства. С 1908 г., «ввиду выраженного бюджетной комиссией Государственной Думы пожелания», к финансовой смете стали прилагать сведения о состоянии специальных средств (ведомость о приходе-расходе сумм, завещанных и пожертвованных в пользу церковно-приходских школ, ведомость о приходе-расходе сумм, состоявших в специальных издательских средствах Св. Синода по Училищному совету, и отдельно печатавшуюся смету доходов и расходов специальных средств Св. Синода)²⁶. К слову сказать, на 1909 г. в смету были внесены новые условные кредиты, позволившие, помимо прочего, увеличить содержание городского и сельского духовенства на 500 000 рублей и выделить на устройство и содержание церковно-приходских школ и школ грамоты 1 000 000 р.

Стоит особо заметить, что в то время объяснительная записка к смете доходов и расходов духовного ведомства не превышала двух страниц текста. Подобное обстоятельство, разумеется, не могло удовлетворять Государственную Думу, желавшую видеть своего рода серьезную «финансовую справку» Св. Синода, объяснявшую представляемую на утверждение смету. Первая такого рода записка впервые появилась в смете духовного ведомства на 1910 г. Ее объем (LXXIV страниц) очевидно диссонировал с теми записками, которые ранее предваряли сметы. Давая пояснение, Св. Синод заявил, что предыдущая (на 1909 г.) записка, по мнению Бюджетной Комиссии, не представляла собою «общего обзора удовлетворяемых управлением потребностей и собираемых им доходов, каковой она должна бы быть по сметным правилам». Комиссия указала для примера на объяснительные записки к сметам некоторых других ведомств, «в коих излагается подробная мотивировка каждого изменения в смете, выясняются взгляды учреждений на отрасли их управления и устанавливается известная планомерность действий». В Государственной Думе считали также необходимым отмечать, в какой мере исполнены ее (Думы) пожелания при рассмотрении сметы ведомств Св. Синода за предшествовавшие годы²⁷. С того времени и до революции 1917 г. практически в конце каждой объяснительной записки содержалась таблица с перечнем вопросов и пожеланий, высказанных депутатами Думы и членами II-го отдела Финансовой Комиссии Государственного Совета при обсуждении сметы духовного ведомства, а также официальные ответы Св. Синода на эти вопросы и пожелания. Год от года объяснительные записки становились все более подробными, а на 1914 г. объяснительная записка вышла даже отдельным изданием²⁸.