Но самый сильный удар по религиозному образованию и в целом по духовно-нравственным устоям населения нанесло Временное правительство, приняв 22 марта 1917 г. постановление "Об отмене вероисповедных и национальных ограничений", а затем, 14 июля 1917 г. – "Постановление о свободе совести". Так начался курс на построение в России внеконфессионального государства. Отныне все установленные действующими узаконениями ограничения в правах Российских граждан, обусловленные принадлежностью к тому или иному вероисповеданию, вероучению или национальности, отменялись. Были окончательно сняты ограничения при поступлении в учебные заведения – как в частные и общественные, так и правительственные. А также употребления родных языков в делопроизводстве частных обществ и при преподавании в частных учебных заведениях[125].

Несмотря на протест церкви, Временное правительство не собиралось предоставлять православию привилегированный статус среди вероисповеданий – речь шла о постепенном отделении РПЦ от государства. В то же время, основные положения, содержащиеся в принятом летом 1917 г. Вторым мусульманским съездом документе под названием "Основы национально-культурной автономии мусульман внутренней России", также сводились к разделению государства и религии. Вводилось придание языку тюрки равноправного статуса с русским языком, а обучение в школах должно вестись на языке тюрки. Повсюду наблюдалось набирающее силу обновленческое движение, одновременно развивались центробежные течения на национальных окраинах России.

Окончательное отделение церкви от государства было провозглашено в Советской России декретом СНК РСФСР от 23 января 1918 г. Была дана свобода "исповедовать любую религию или не исповедовать никакую". В то же самое время был наложен запрет на религиозное образование во всех государственных и общественных, а также частных учебных заведениях, где преподаются общеобразовательные предметы. Религиозные организации лишались каких-либо прав собственности, было объявлено о переходе имущества существующих в России церковных и религиозных обществ в народное достояние.

Движение шакирдов-ислахистов началось, как мы знаем, еще в 1906–1907 гг. Шакирды больше не хотели жить на подаяния «садака», потеряв на изучение религии свои 10–15 лет жизни в душных медресе. Они хотели изучать науку, получить настоящую профессию и стать полноценными членами общества. Они уже тогда стали требовать от своих преподавателей ввести научные дисциплины в учебный план, но преподаватели сами не знали эти предметы. Выдвигались шакирдами требования об уничтожении медресе старого типа с их схоластикой и широкого введения новых методов обучения, которые применялись в русских школах. Из этих медресе вышли выпускники, которые раньше других начали создавать после Октябрьской революции благоприятные условия для развития светской школы.