За рубежом говорили, что в дни переворота в Москве погибло более 2 тысяч человек. Несколько поляков – очевидцев мятежа московской знати составили именные списки убитых. Сопоставление этих списков позволяет установить, что жертвами стали 20 шляхтичей, близких ко двору молодого царя и около 400 сот их слуг и челядинцев. Те же цифры назвали в письмах из Москвы иезуиты из окружения убиенного государя. Кроме того, в схватках с москвичами погибло ещё несколько сот наёмных солдат из польских рот. Скорее всего, и потери москвичей, дравшихся против поляков, приблизительно равнялись тысячи человек.

Узнав о событиях в Москве и о провале своих планов и надежд, связанных с Москвой вожди заговорщиков-рокошан Николай Зебжидовский, Ян Щасный Гербурт, Станислав Стадницкий и виночерпий Литвы Януш Радзивилл в мае 1606 года призвали польско-литовскую шляхту к открытому восстанию против короля. Но время было упущено, восстание было подавлено…

Уже в начале XX века были обнаружены документы о заупокойных вкладах, сделанных около 1606–1610 года инокиней Марфой (вдовой царицей Марией Нагой) по своему сыну Димитрию. Но и в том же 1606 году царевич Димитрий был канонизирован. Отныне всякий, кто выдавал себя за него, становился святотатцем. Впрочем, это не остановило самозванцев. Останки же убиенного государя были сожжены сподвижниками Шуйского и захоронены на кладбище близ подмосковного села Нижние Котлы.

Судьба и конец Григория Отрепьева скрыты в недрах истории. Тогда след Отрепьева и его соратников, вероятно, затерялся где-то южнее Воронежа – в казачьих станицах большой излучины Дона. Может быть яд или ножи заговорщиков достали их и там? Хотя, узнав о событиях в Москве в мае 1606 года, Отрепьев мог «нырнуть» в омут казачьей вольницы где-нибудь на Волге или на Дону и «вынырнуть» в ходе Смуты под другим именем позже. Как знать? Не прост был Юрий Отрепьев…

Положение Ксении, принявшей постриг (инокини Ольги) изменилось с воцарением Василия Шуйского. Сначала её перевели в Успенский Княгинин монастырь. Затем в том же 1606 году царь Василий приказал торжественно перенести тело Бориса Годунова, его жены и сына из Варсонофьева монастыря в Троице-Сергиеву Лавру. Гроб Фёдора Борисовича несли 20 бояр. В Троице-Сергиевом монастыре в особой усыпальнице они покоятся и ныне.

Инокиня Ольга следовала за процессией в закрытых санях. Иностранцы сообщают о плаче инокини-сироты по своим близким во время этой процессии. Затем она поселилась в находящемся неподалеку Подсосенском монастыре (ктитором монастыря был её отец Борис). Там в то же время находилась и бывшая Ливонская королева Мария Владимировна – дочь князя Владимира Андреевича Старицкого. Она была вдовой короля Магнуса. До пострига она была следующей в линии престолонаследия после царевича Димитрия…