Основные принципы осуществления уголовного правосудия формируются идеями свободы выбора добра (истина) или зла (ложь, насилие); равенства всех людей (равное право) перед законом и равные возможности; справедливости, когда при выборе добра человек становится лично свободным и лично ответственным, а при выборе зла заслуживает наказания в виде зависимой и подавленной воли.

Уголовно-правовые принципы законности, равенства граждан перед законом, вины, справедливости и гуманизма образуют систему прав человека в условиях уголовного преследования в сочетании с презумпцией невиновности и свободой совести.

Так, принцип законности предусматривает, что преступность деяния, а также его наказуемость и иные уголовно-правовые последствия определяются только Уголовным кодексом РФ. Применение уголовного закона по аналогии не допускается. Законность является стержнем правопорядка, стабильность которого зависит от реализации принципа презумпции невиновности. Реализация презумпции невиновности, в свою очередь, обеспечивает саму идею законного разрешения уголовного дела, заключающуюся в том, чтобы только виновный в совершении преступления был осуждён, а невиновный — оправдан. Уголовно-правовой принцип законности означает, что если нет преступления, то нет и наказания.

Принцип равенства граждан перед законом подлежит толкованию в системном единстве с другими принципами, поскольку относится к лицам, совершившим преступления, которые равны перед законом и подлежат уголовной ответственности независимо от перечисленных в законе, а также других обстоятельств. Именно эти лица подпадают под действие презумпции невиновности и нуждаются в защите от обвинения, пока не будет доказано обратное. Тем более, независимо от совокупности и объёма различных обстоятельств, которыми люди отличаются друг от друга в разной степени. Этим принципом запрещены любые формы ограничения прав граждан по указанным в законе признакам (независимо от пола, расы, национальности, языка, происхождения, имущественного и должностного положения, места жительства, отношения к религии, убеждений, принадлежности к общественным объединениям), перечень которых подлежит расширительному толкованию. Принцип равенства граждан перед законом не допускает дискриминацию в пользовании правами и свободами по каким-либо основаниям, зависящим от естественных особенностей личности и её социального статуса.

Согласно принципу вины, лицо подлежит уголовной ответственности только за те общественно опасные действия (бездействие) и наступившие общественно опасные последствия, в отношении которых установлена его вина. Объективное вменение, то есть уголовная ответственность за невиновное причинение вреда, не допускается. Принцип вины в разрыве с презумпцией невиновности означает заведомую виновность обвиняемого в преступлении и гарантированный так называемый обвинительный уклон, что делает бесполезными Конституцию РФ и уголовный закон. Вина, наряду с мотивом и целью, образует субъективную сторону преступления, без чего отсутствует состав преступления, а значит, и уголовная ответственность. Принцип вины предполагает личную, персональную ответственность. Ответственность за «связь с преступной средой», «опасное состояние», «мысли» и тому подобное — исключается.