Для изучения всех обстоятельств левоэсеровских мятежей Советское правительство создало Особую следственную комиссию под председательством П. Стучки. 7 июля 1918 г. Дзержинский обратился в СНК с просьбой об освобождении его с поста председателя ВЧК: «Ввиду того, что я являюсь, несомненно, одним из главных свидетелей по делу об убийстве германского посланника графа Мирбаха, я не считаю для себя возможным оставаться больше во Всероссийской Чрезвычайной комиссии по борьбе с контрреволюцией и пр. в качестве ее председателя, равно как и вообще принимать какое-либо участие в комиссии. Я прошу Совет Народных Комиссаров освободить меня от работы в комиссии»[633].

СНК удовлетворил просьбу Дзержинского, оставив его членом Коллегии ВЧК. Председателем комиссии назначен Я.Х. Петерс. В отдельных случаях Дзержинский принимал участие в следствии по левоэсеровскому мятежу. В частности, он вел разбирательство дела морского офицера С.С. Карцева, арестованного ВЧК по подозрению в связях с левыми эсерами. И 9 июля 1918 г. после беседы с Карцевым написал справку в ВЧК: «Сим удостоверяю, что тов. Карцев Сергей Сергеевич пришел ко мне как к председателю Вс. Чр. комиссии с докладом о контрреволюционерах, дезорганизующих военные наши силы в Петрограде. Доклад этот у меня, копии переданы тов. Троцкому и Урицкому. С Aлександровичем тов. С. Карцев познакомился как с товарищем председателя ВЧК, раньше с ним знаком не был. Тов. Карцев явился ко мне по поручению тов. Юренева… С моей стороны препятствий к возвращению тов. С. Карцеву оружия не имеется»[634].

В начале октября 1918 г. Дзержинский выехал в Швейцарию по настойчивому совету Я.М. Свердлова на отдых и для свидания с семьей, которую не видел около восьми лет. Возможно, была еще какая-то тайная цель: он посетил Берлин, встречался с немецкими коммунистами. Перед выездом он сбрил бородку, шевелюру, приоделся по-заграничному и с документами на имя Феликса Доманского. В Швейцарии жена его работала в советской дипломатической миссии. И Дзержинский прибыл как бы по делам советской миссии, чтобы повидать жену и сына и немного отдохнуть (белых отбросили на всех фронтах, на внутреннем фронте разгромлен савинковский «Союз», ликвидирован заговор Р.Г.Б. Локкарта, активность контрреволюции понизилась). Против поездки не возражал В.И. Ленин. Я.М. Свердлов «на всякий случай» направил с Дзержинским секретаря Президиума ВЦИК В. Аванесова, который мог взять под свою защиту в случае каких-либо осложнений.

Дзержинский проживал в Берне, часть отпуска провел с женой и сыном в Лугано. В конце ноября Дзержинский и Аванесов выехали из Швейцарии через Берлин в Москву, за несколько дней до первой годовщины революции. И как раз вовремя. 5 ноября германское правительство порвало дипломатические отношения с Советской Россией и выслало из Германии советское посольство. 9 ноября отрекся от престола Вильгельм II. Монархия в Германии пала, но власть оказалась в руках буржуазии[635].