Учитывая опасность повстанческого движения и бандитизма, политическое руководство страны уделило большее внимание этой проблеме. Она рассматривалась высшими советскими органами власти и управления, а основные политические директивы разрабатывались на уровне ЦК РКП(б) – ЦК ВКП(б): об усилении борьбы с бандитизмом и восстаниями в Тамбовской губернии. Сибири, на Украине и в других районах страны. Так, различные проблемы борьбы с повстанчеством и бандитизмом Политбюро обсудило 27 апреля, 7 июня, 16 июля 1921 г., 3 и 30 января 1922 г., 9 марта 1922 г., 29 декабря 1923 г., 9 октября 1924 г. 18 октября 1921 г. Пленум ЦК РКП(б) заслушал доклад о «красном бандитизме», обсужденном до этого на Оргбюро ЦК в июле месяце. А в январе 1922 г. Политбюро ЦК РКП(б) рекомендовало ВЧК и Особому отделу обеспечить «более солидную службу внутреннего осведомления в Карелии». В 1925 г. ЦК РКП(б) несколько раз обсуждал вопрос о ликвидации мятежа в Якутии. Проблемы Северного Кавказа, чаще всего Чечни, были обсуждены в Политбюро 18 октября 1923 г., 24 января 1924 г., 1 октября 1925 г., 29 июля 1926 г.
Вопросы подавления восстания и ликвидации бандитизма стали предметом рассмотрения ЦК компартий союзных республик и областных бюро ЦК. На Украине они обсуждены в феврале 1921 г. на Пленуме ЦК КП(б)У и в мае 1921 г. – на Всеукраинском партийном совещании; Юго-Восточное бюро ЦК 27 апреля 1921 г. объявило военное положение в округах, «зараженных бандитизмом», а в июне создало специальную краевую тройку из представителей СКВО, бюро ЦК и уполномоченного ВЧК; Сибирское бюро ЦК обсудило вопросы ликвидации бандитизма 22 марта, 25 и 26 апреля 1921г. и 10 октября 1922 г.
Конкретное проведение политической линии в жизнь по борьбе с повстанчеством и бандитизмом осуществляли и местные советы, и парткомы, которые хорошо знали специфику своих районов, тактику борьбы с противником. Как правило, губкомы давали поручения председателям губЧК (начальникам губотделов ГПУ) и военному командованию. В 1921 г. планы борьбы с бандитизмом при участии чекистов разработаны Курским, Иркутским, Новониколаевским, Тамбовским и другими губкомами.
12 января 1921 г. Пленум ЦК РКП(б) после обсуждения вопроса о настроении среди крестьянства решил назначить комиссию составе Ф.Э. Дзержинского, главкома С.С. Каменева, С.С. Данилова и Ф.А. Артема с заданием специально подготовить меры военной ликвидации бандитизма[864].
27 января начала работать Центральная межведомственная комиссия по борьбе с бандитизмом. Общее руководство военными операциями В.И. Ленин поручил Главному командованию Красной армии. Эта комиссия состояла из представителей СТО, РВС Республики, ВЧК (ГПУ), ЧОН, НКПС, НКПрод, Главного командования РККА, ЦК РКП(б). Она работала под непосредственным руководством СНК и ВЦИК РСФСР, ЦК РКП(б). Только в 1921—1922 гг. она рассмотрела десятки вопросов об участии чекистов в борьбе с восстаниями и бандитизмом: 12 февраля 1921 г. решила направить коммунистов и группу чекистов в Тамбов, 17 марта – ввести строгий учет бывших офицеров и наладить получение информации о настроениях в воинских частях, участвующих в подавлении восстаний и бандитизма; 20 марта – активизировать борьбу с бандитизмом в Поволжье силами чекистов; 24 апреля – усилить борьбу с антоновщиной и нанести удар по бандитизму на Кавказе[865].