Мешало эффективной борьбе с басмачами отсутствие единого продуманного плана, рассчитанного на решительное искоренение басмачества. Ход всех военных и чекистских операций регулировался лишь отдельными общими указаниями и распоряжениями зампреда ОГПУ Г.Г. Ягоды. Но объединенными усилиями пограничников и чекистов к середине 1926 г. главные силы басмачей, находившиеся в Таджикистане и на юге Узбекистана, были разбиты, а их остатки вместе с Ибрагим-беком бежали в Афганистан.
С 1 июля 1926 г. для отпора вооруженным налетам оставшихся небольших отрядов басмачей на населенные пункты и военные гарнизоны пограничники усилили охрану штабов и комендатур, органы ОГПУ активизировали агентурную работу и разведку в 50-верстной полосе. Разведка велась непрерывно как за кордоном, так и в нашей приграничной полосе для получения информации о басмаческих группировках, их составе и вооружении, местах дислокации, времени и направлениях, о возможных действиях в целях прорыва через нашу границу. Разведывательная работа проводилась в тесной связи с оперативными аппаратами пограничных комендатур и отрядов. Большую помощь погранохране в добывании разведывательной информации оказывали республиканские и областные органы и ПП ОГПУ по Средней Азии.
Борьба с басмачеством завершена лишь в 1930-х гг.
16 ноября 1922 г. Дальневосточное бюро ЦК РКП(б) постановило: признать целесообразным посылку парохода на Камчатку с военной охраной и продовольственными грузами. А уже 22 ноября главком 5-й армии И.П. Уборевич подписал приказ о формировании Камчатской экспедиции из 1-й Забайкальской дивизии во главе с М.П. Вольским. Экспедиция должна была уничтожить банды Бочкарева и А.Н. Пепеляева.
21 декабря 1922 г. отряд Вольского высадился в Петропавловске-Камчатском, в него входил 251 человек. Бандитская «армия» во главе с вожаком выступала с обращениями к красноармейцам и чекистам. В одном из них говорилось: «Мы не хотим войны, пусть комиссары соберут народных представителей, пусть соберут Учредительное собрание, пусть сам народ выберет себе власть – мы подчинимся этой власти и будем ея слугами»[913].
Генерал А.Н. Пепеляев направил просьбу адмиралу О.В. Старку о присылке подкрепления с новым пароходом. В борьбе с восставшими по указанию секретаря губернского бюро РКП(б) Лебедева проводилась политика красного террора для того, чтобы «навести ужас на якутов». С его ведома была издана секретная директива о расстреле каждого пятого из мирного населения, разграблении имущества всех сочувствовавших повстанцам. Но отряд В.К. Вольского не смог выполнить поставленную задачу, не имея точных данных о нахождении пепеляевцев. Поэтому Уборевич приказал отряду Вольского закрепиться на Камчатке и «способствовать там организации советской власти». Для очищения Охотского района подготовили 2-ю экспедицию, а в сторону Удско-Кербинского уезда, в Гумикан, направили отряд ГПУ под командованием А.Н. Липского.