Летом 1923 г. окончена борьба с бандитами в Якутии. 4 июня в 30 км от Охотска высадился отряд С.С. Вострецова. 13 июня пароход второй экспедиции подошел, высадил десант на берегу, и отряд пошел на Аян. В ночь с 17 на 18 окружили Аян. До этого в 200 верстах от Якутска, при 35-градусном морозе с пепеляевцами сражался небольшой отряд красноармейцев под командованием Строда. Они в течение 22 суток выдержали осаду и 5 яростных атак. Пришедшие на помощь части Охотско-Камчатского края после полутора тысяч верст перехода на собаках и лыжах разгромили наголову бандитов. Пепеляев решил сдаться. С ним было пленено 103 офицера и 230 солдат. Уйканский белогвардейский отряд полковника Степанова, продвигавшийся вдоль побережья, был перехвачен чекистами во главе с Липским.

В 1925 г. ЦК РКП(б) несколько раз обсуждал вопрос о ликвидации мятежа в Якутии. 21 апреля 1925 г. даже была создана специальная комиссия для разработки всех необходимых мер военно-экономического характера по ликвидации мятежа, при этом особая роль была отведена ОГПУ, а Военное ведомство должно было оказывать ему всемерное содействие.

21 мая 1925 г. после обсуждения вопроса «О ликвидации тунгузского восстания» Политбюро ЦК РКП(б) срочно решило направить в Якутию комиссию для ознакомления с причинами бандитизма и выяснения возможностей для мирной ликвидации мятежа. Комиссии было поручено на месте выяснить целесообразность призыва в армию повстанцев и наметить меры по переброске вошедших в армию повстанцев в другие места, не подверженные восстанию; посылку войск произвести в сокращенном размере: по линии Военведа вместо четырех рот – две, и по линии ОГПУ вместо 300 человек – 150 и подтвердить, что командование всеми военными силами в районе восстания до его полной ликвидации находится в руках представителя ОГПУ т. Альпова. А 11 июля 1925 г. Политбюро ЦК РКП(б) по предложению Г.Г. Ягоды обязало руководство ОГПУ, в целях пресечения бандитизма, принять меры «для более успешного пресечения развития бандитизма в будущем считать необходимым полную ликвидацию головки восстания (остатки пепеляевских офицеров, агенты американского капитализма и др.) путем постепенного удаления их из области»[914].

К борьбе с бандитизмом в Якутии Политбюро ЦК ВКП(б) возвращалось 17 ноября 1927 г. и 21 января 1928 г.

Как и в предыдущие годы, оправданной мерой в борьбе с бандитизмом было установление строгого контроля над наличием оружия у населения. Так, Петроградское губернское совещание по борьбе с бандитизмом предложило отделу ГПУ и уголовному розыску «принять меры по изъятию оружия, главным образом военного образца, из торгового оборота, привлечения всех виновных в хранении последнего».