С началом Первой мировой войны Швейцер был на несколько лет оторван от своего детища. Его, как германского подданного, интернировали, поместили в лагерь, из которого освободили в 1918 г. по обмену на французских пленных.
Последующая работа в страсбургской муниципальной больнице, органные концерты и лекции, а также гонорары от книги о Бахе позволили Швейцеру расплатиться со старыми долгами, собрать сумму, необходимую для восстановления разрушенной в годы войны больницы и в 1924 г. вернуться в Ламбарене.
За два года врач построил новый больничный комплекс и укомплектовал его медицинскими кадрами, состоявшими из добровольцев. Больница славилась как образцовая и во время отлучек (порой продолжительных) главного врача в Европу продолжала работать, как отлаженный механизм.
В Европе Швейцер писал книги, концертами и лекциями зарабатывал деньги, на которые несколько лет мог содержать больницу, после чего возвращался в Африку.
В 1928 г. Альберту была присуждена Франкфуртская премия Гете, на которую он построил в Гюнсбахе дом отдыха для персонала больницы Ламбарене.
Самая напряженная работа выпала Швейцеру-врачу в годы Второй мировой войны, когда ему пришлось заниматься ранениями и хирургическими операциями. Больничный комплекс в эти годы значительно разросся и к 1960-м гг. насчитывал более 70 зданий и 500 врачей и медсестер.
В 1951 г. Швейцер получил премию Мира западногерманской ассоциации книгоиздателей и книготорговцев. В том же году он стал «бессмертным» членом Французской академии.
В 1953 г. Швейцеру присудили Нобелевскую премию мира. Дабы не отрываться от насущных дел, лауреат на церемонию награждения не поехал, и премию принял французский посол в Норвегии.
Во всем мире Швейцер был известен как борец за национальную независимость африканцев, за права туземцев на проживание и свободное передвижение по стране, на землю, на свободный выбор труда. В последние 10 лет жизни гуманист прославился своим работами, выступлениями, лекциями по проблемам мира и прекращения атомных испытаний.
За несколько дней до кончины Швейцер подписал обращение лауреатов Нобелевской премии к главам правительств крупных государств с требованием немедленно прекратить преступную войну во Вьетнаме.
Альберт Швейцер скончался в Ламбарене 4 сентября 1965 г. Похоронен под окнами своего кабинета, рядом с женой, умершей в 1957 г. Больницу возглавила их дочь Рена.