В связи с вооруженностью бандформирований современными видами стрелкового оружия, в том числе иностранного производства, подразделениям СОБРа отводилась весьма важная роль. До создания силового блока бандиты в случае их задержания весьма часто применяли оружие против оперативных сотрудников, которые, как правило, были вооружены пистолетами Макарова и не имели специальной подготовки. Поэтому в ходе подобных мероприятий они несли потери. Бойцы специальных подразделений обладали навыками задержания преступников и в случае применения бандитами огнестрельного оружия с ними не очень церемонились, а открывали ответный огонь на поражение.
О жестком обращении созданного спецназа в подразделениях ГУОП сразу же стало известно в криминальных кругах. Впоследствии при участии бойцов СОБРа в задержании вооруженных бандитов, как правило, сопротивление не оказывалось, в противном случае их просто уничтожали. На крайние меры шли только единицы, которым нечего было терять. Среди оперативников потери сразу уменьшились.
Важное значение в повышении эффективности борьбы в данном направлении приобрело положение указа, согласно которому начальник Главного управления по организованной преступности являлся первым заместителем министра внутренних дел. Руководители региональных подразделений стали заместителями начальника главка. Они назначались на должность и освобождались от выполняемых обязанностей приказом министра внутренних дел.
Такой статус позволял специальной службе вести оперативные разработки любых должностных лиц на уровне субъектов Российской Федерации и ряда высокопоставленных чиновников федерального уровня. Независимость от властей регионального уровня и приобретаемая значимость не давали покоя руководителям некоторых государственных структур, включая силовые ведомства, которые предпринимали меры с целью ослабления позиций и важности по своей сути уникальной службы.
Забегая вперед, необходимо подчеркнуть, что межведомственные противоборства не прошли даром. Через двадцать лет, а именно 6 сентября 2008 года, специальная служба МВД ликвидируется, аналогов которой в структуре органов внутренних дел ни в СССР, ни в России не существовало. В результате недальновидных политических решений была упразднена годами создававшаяся система противодействия организованной преступности. Последствия граждане пожинают до сих пор. Достаточно вспомнить банду, действовавшую в одной из станиц Краснодарского края на протяжении более десяти лет. В настоящее время подобные криминальные структуры существуют практически во всех регионах России.