Произошло все это прямо на глазах у Ивана Васильевича, который наблюдал с близлежащего холма за штурмом белокаменного замка. Царь пришел в неистовство, поскольку любил своего начальника сыскного приказа за его звериную преданность.
Для того чтобы наказать защитников крепости за гибель Скуратова, царь приказал всех, кого пленили, привязать к копьям и зажарить на медленном огне. Воскресить погибшего это не помогло, но жажду мести царь отчасти утолил.
По приказу царя тело Скуратова было отвезено для отпевания в Иосифо-Волоколамский монастырь. В монастыре его похоронили рядом с могилой отца.
Царь велел поминать своего любимца в этом монастыре на службах и «дал по холопе своем по Григорье по Малюте Лукьяновиче Скуратове» вклад в 150 рублей. Это было много больше, чем сделанные им ранее поминальные вклады по брату Юрию или по жене Марфе.
Жене Скуратова – Марье царь назначил большую пенсию и платил ее до конца жизни. Причина этого заключалась в том, что у самого близкого на тот момент к царю человека не оказалось собственного поместья, с которого могла бы жить его жена. Вышло, что служил Скуратов, как и требовал от него царь, из личной преданности и материальной выгоды не искал.
Царь с сыновьями, осадной артиллерией и стрельцами после гибели Скуратова вернулся от Вайссенштайна в Великий Новгород. Конные же отряды опричников должны были продолжить военные действия в Ливонии.
Кампания пошла ни шатко, ни валко. Князь Иван Андреевич Шуйский погиб без поддержки осадных пушек при осаде замка Лоде, а его полк понес большие потери. Михаил Безнин осаждал Колывань, но взять город без осадных орудий и пехоты тоже не смог.
Воевал в Ливонии и Дмитрий Иванович Хворостинин. Он удачно брал небольшие замки и укрепленные мызы. Под командой воеводы опять оказался отряд рейтар Юргена фон Фаренсбаха. Хворостинин напомнил ему, что не позволит наемникам обирать павших русских воинов.
Немцы подумали-подумали, да и дезертировали всем отрядом к пригласившим их на службу датчанам. Те денег платили больше и принципиально против мародерства не возражали. В рядах датской армии предприимчивый капитан вскоре дослужился до поста наместника своего родного острова Эзель, который уже некоторое время находился под власть Копенгагена.
После окончания военной кампании 1573 г. в Ливонии многие видные опричники были отправлены царем на службу по разным малозначимым местам. Например, Василия Григорьевича Грязного, одного из ведущих руководителей опричнины, отправили командовать небольшим гарнизоном в Нарву, а потом и вовсе охранять южные рубежи царства. Там он попал в плен к кочевникам. Татары хотели обменять его на сидящего в московском плену Дивей-мурзу, либо просили выкуп в сто тысяч рублей, но царь не соглашался.