Для того чтобы перекрыть каналы проникновения агентов противника через линию фронта, заградительная служба военной контрразведки и Красной армии совместно с подразделениями войск НКВД по охране тыла задерживали и проверяли не только военнослужащих, но и других лиц, возвращавшихся из окружения или бывших в плену у противника. Особое внимание уделялось военнослужащим, неорганизованно пробиравшимся с фронта в прифронтовую полосу, покидавшим поле боя, выявлению дезертиров, трусов и паникеров, а также лиц, подозреваемых в проведении разведывательной и диверсионной деятельности. В случае возникновения подозрений после осмотра личных вещей у гражданских лиц и военнослужащих, досмотра автотранспорта на месте проводился их краткий опрос, а при необходимости – разбирательство. Выяснялись обстоятельства пленения, побега или освобождения из плена и другие факты.

Важность организации эффективной заградительной службы хорошо понимали не только в НКВД, а и в Красной армии. Ввиду отвлечения погранвойск от выполнения обязанностей по охране тыла действующей армии, они не могли эффективно решать эту задачу на всех участка фронта. Именно этим было вызвано появление телеграммы № 0533 от 26 июля 1941 г. генерала армии Г.К. Жукова главнокомандующим войсками направлений и фронтов следующего содержания: «Через линию заградительных отрядов просачивается в глубокий тыл очень большое количество командиров и красноармейцев. Проникая в глубокий тыл, они своим появлением и преувеличенными сообщениями дезорганизуют население и распространяют панику. Расследованием установлено:

1. Заградслужба в тылах армий и фронтов организована очень низко, и стоит она только на дорогах.

2. При задержании вместо немедленного направления во фронтовые части задержанных направляют глубже в тыл.

Ставка приказала немедленно лично разобраться, как организована заградслужба, и дать начальникам охраны тыла исчерпывающие указания. Всех задержанных вливать во фронтовые части и в тыл не направлять»[989].

Учитывая сложное положение на фронтах, некоторые командующие считали, что для охраны тыла Красной армии недостаточно заградительной службы войск НКВД и предложили И.В. Сталину создать заградотряды непосредственно в частях и соединениях Красной армии. Именно с такой просьбой в Ставку ВГК обратился командующий Брянским фронтом генерал А.И. Еременко. По поручению Ставки ВГК нач. Генерального штаба Б.М. Шапошников ответил А.И. Еременко в директиве № 001650 от 5 сентября: «Ставка ознакомилась с Вашей докладной и разрешает Вам создать заградительные отряды в тех дивизиях, которые зарекомендовали себя как неустойчивые. Цель заградительных отрядов – не допускать самовольного отхода частей, а в случае бегства остановить, применяя при необходимости оружие»[990].