Английские исследователи Чарльз Диксон и Отто Гейльбрунн не считали НКВД «партизанской структурой»: «Политическая полиция имела многочисленных своих представителей в партизанских штабах различных ступеней, и вместе с партизанами сражалось немало людей из НКВД. Однако у нас нет никаких данных, которые свидетельствовали бы о том, что НКВД был связан с партизанскими формированиями теснее, чем с каким-либо другим движением, проводившимся под его надзором»[1051].
На местах, как это было в Калининской области, 20 июля 1941 г. нач. УНКГБ, майор ГБ Токарев издал директиву нач. межрайонных и железнодорожных отделов УНКГБ о мероприятиях по формированию партизанских отрядов[1052]. В Ленинградской области была образована оперативная группа по руководству партизанским движением в оккупированных районах в составе секретаря обкома ВКП (б) Г. X. Бумагина, зав. военным отделом обкома М.Ф. Алексеева и сотрудника УНКГБ по Ленинградской области Л.И. Кожевникова. 27 сентября 1941 г. эта группа была преобразована в Ленинградский штаб партизанского движения во главе с секретарем обкома ВКП (б) М.Н. Никитиным. К 1942 г. уже действовали 287 партизанских отрядов общей численностью до 18 тыс. человек[1053].
С января 1942 г. в интересах организации партизанского движения в тылу противника началось более активное использование оперативных групп. Это было обусловлено тем, что во вражеском тылу не хватало организаторов партизанского движения, специалистов по агентурной разведке и диверсиям. Оперативные группы, как правило, состояли из командира, его зам., нескольких разведчиков и радистов.
До середины 1942 г. самыми слабыми местами в партизанском движении были плохая подготовка партизан и отсутствие четкого взаимодействия различных структур, упорядоченности и координации усилий в руководстве народной борьбой с оккупантами. В опубликованных дочерью сотрудника Разведуправления Генштаба мемуарах описывается случай, когда в первый год войны сотрудники НКВД расстреляли агентуру армейских разведорганов, завербованную последними среди полицаев-коллаборационистов[1054]. Даже после создания штабов партизанского движения зафронтовой борьбой все, описанные выше структуры, фактически действовавшие независимо друг от друга.
Исходя из директивы 3-го управления НКО СССР от 27 июня, военная контрразведка была нацелена на работу в тесном контакте с территориальными органами госбезопасности. Руководители ОО НКВД фронтов обязывали своих подчиненных на взаимодействие и с другими отделами, службами, руководившими борьбой партизан. Так, 5 августа 1941 г. нач. ОО НКВД Северо-Западного фронта Бочковым всем руководителям ОО было указано, что в связи с проводимой работой по линии партизанского движения в тылу противника необходимо оказывать всяческое содействие партийным, чекистским органам в деле организации переброски, обеспечения партизанских отрядов, а также групп «Д»[1055].