Духовным завещанием владыки стала его последняя статья, опубликованная в «Руси Православной» 5 октября 1995 г., «Смотрите, не ужасайтесь», посвященная главной ереси XX века – экуменизму. Известно, что против национальной государственности народов и соборного начала человеческого бытия – гаранта мировоззренческой целостности общества и его нравственного здоровья, сыны тьмы используют 2 коварных лжеучения: политический мондиализм с идеей мирового правительства и религиозный ЭКУМЕНИЗМ как объединение всех вероучений под верховным контролем талмудического иудаизма. Пытаясь растворить Православие в омуте чужеродных конфессий и сект, экуменизм нацелился лишить нас не только полноты Божественной Истины, но еще и подчинить наш народ – через «прогрессивное» единение с еретиками – христоненавистническому культу международной финансовой плутократии. Главным орудием духовного заговора стал созданный протестантами Всемирный совет церквей, куда втолкнул наш епископат космополит Хрущев. При этом была попрана резолюция Конференции Православных Поместных Церквей (Москва, 1948 год) об ОТКАЗЕ участвовать в экуменическом движении. В 1948 г. решение о несоответствии идеалу христианства целеустремлений экуменизма подписали тогдашний Патриарх Московский и всея Руси Алексий Первый и еще ОДИННАДЦАТЬ православных первоиерархов. «До сей поры, – отмечает митрополит Иоанн, – никто даже не пытался оспорить его (решения) значимость и каноническое достоинство». Владыка приводит мнение александрийского патриарха Николая VI, оценившего «сверхъересь» экуменизма как «вместилище всех ересей и зловерий», поддерживает решение предстоятеля Иерусалимской Православной Церкви Патриарха Диодора, прекратившего все экуменические контакты. Особо подчеркнута митрополитом Иоанном каноническая позиция Русской Зарубежной Православной Церкви, им неизменно уважаемой, которая вполне официально внесла в богослужебный чин (Последование в неделю Православия) анафематство-вание экуменистам следующего содержания: «Нападающим на Церковь Христову и учащим, что она разделилась на ветви… и тем, кто имеет общение с такими еретиками, или способствует им, или ЗАЩИЩАЕТ ЕРЕСЬ ЭКУМЕНИЗМА, полагая ее проявлением братской любви и единения разрозненных христиан – АНАФЕМА». («Советская Россия» – «Русь Православная» № 113 от 5.10.1995 г.)

Озабоченность митрополита Санкт-Петербургского и Ладожского продолжающимся пребыванием нашей Церкви в масонском Всемирном совете церквей, увы, не нашла отклика в сердцах других членов Священного Синода. Патриарх Алексий Второй, выступая в конце июня 1995 г. в Женеве в штаб-квартире ВСЦ, заявил: «Отношение Русской Православной Церкви к Всемирному совету церквей определяется прежде всего ее положительным отношением к экуменическому движению в его совокупности. Об этом свидетельствует ее 50-летнее активное сотрудничество с другими Церквями и религиозными общинами, ставящее себе целью восстановление единства в вере разделенного христианства…» Патриарх подчеркнул «право каждого человека выбирать для себя принадлежность к той или иной религии». (Газета «Русская мысль» № 4086 от 13–19 июля 1995 г., текст Ирины Иловайской «Патриарх Алексий II в Женеве»).