Пепеляев установил организационную связь с известными ему белогвардейскими офицерами и поручил им проведение вербовки повстанческих кадров и создание террористических и диверсионных групп. Из доклада генерал-майора Н. А. Эскина Пепеляев знал о наличии в Западно-Сибирском крае повстанческой организации, насчитывающей несколько тысяч членов.
Органами НКВД организация РОВС была частично ликвидирована. Было арестовано и осуждено руководство краевого повстанческого штаба в составе бывших генералов Эскина, Михайлова, Шереметьева, Ефанова и князей Гагарина, Долгорукова, непосредственно руководивших формированиями повстанческого подполья и диверсионно-террористическими группами.
Всего по делу Западно-Сибирской организации РОВС было арестовано и осуждено 15 203 чел. В ноябре в Новосибирске был вскрыт и ликвидирован запасный повстанческий штаб повстанческой организации, созданный Эскиным, в состав которого входили бывшие полковники армии А. В. Колчака А. А. Нуднер, Н. Л. Попов, Н. М. Тюменев, Г. С. Полынов.
Одновременно в системе Сиблага была вскрыта широко разветвленная повстанческая организация РОВС, охватывающая 17 лагерных пунктов. Восстание намечалось вместе с организацией РОВС Западной Сибири в момент начала войны с Японией. Организация создавалась по признакам войскового подразделения. В первую очередь подбирался командный состав из числа отбывавших наказание офицеров.
Позже было арестовано еще 357 чел., из них бывших генералов 1, бывших полковников 7, бывших подполковников 4, других офицеров 140, полицейских жандармов 20, митрополитов-епископов 6, попов 69, кулаков, карателей 139. Призналось в участии в организации 345.
Резолюция Сталина на этом документе гласила: «Ежову. Всех бывших офицеров и генералов по записке Горбача нужно расстрелять»313.
Согласно справке УНКВД СССР по Новосибирской области от 13 декабря 1937 г. о составе арестованных, по делу офицерской организации РОВС проходило:
«1. Князей – 2
2. Контр-адмиралов – 1
3. Генералов – 8
4. Полковников – 42
5. Капитанов и штабс-капитанов – 43
6. Поручиков, подпоручиков и прапорщиков – 102
7. Царских чинов – 61
8. Чинов полиции и жандармерии – 69
9. Дворян – 27
10. Фабрикантов и помещиков – 35
11. Попов – 9».
Резолюция Сталина: «Расстрелять всех». А. Н. Поскребышевым подписано: «Исполнено. Послана телеграмма 16. XII.37 г.»314.
Раскрытие такой «крупной» организации, существовавшей в течение нескольких лет, вызывает большие сомнения. Скорее всего, большая часть лиц была арестована и осуждена безосновательно. Их уничтожение было связано с ликвидацией в стране т. н. «пятой колонны».