Иоанна оказалась довольно фертильной женщиной, за первые десять лет брака у нее и Франческо родилось шестеро детей. К сожалению, это были одни девочки: Элеонора, Ромола, Анна, Изабелла, Лукреция и самая младшая – Мария. Ромола, Изабелла и Лукреция скончались в младенчестве, Анна прожила 15 лет и умерла от туберкулеза. Из шести дочерей выжили только две: старшая Элеонора и младшая Мария. Элеонору выдали замуж за Винченцо Гонзага, герцога Мантуи и Монферрато. В этом браке родилось шестеро детей: четыре сына и две дочери. Самая младшая дочь Винченцо и Элеоноры, внучка Франческо Медичи и Иоанны Австрийской, по имени Элеонора Анна Мария, сочеталась браком с императором Священной Римской империи Фердинандом II и сама стала императрицей. Младшая дочь Франческо и Иоанны, Мария Медичи, вышла замуж за короля Генриха IV и стала второй французской королевой из этого рода.

Бьянка выражала сочувствие любовнику каждый раз, когда объявляли о рождении у принца дочери. Но в глубине души она этому радовалась и надеялась сама родить ему сына, который унаследует престол Тосканы. В 1569 году она овдовела: ее муж Пьетро Бонавентури был убит на углу улицы Маджо, недалеко от дворца Бьянки. Они давно уже жили врозь, связь наследника престола и Бьянки Каппелло была известна всем во Флоренции, и сами любовники этого не скрывали. Поэтому Пьетро тоже не считал себя обязанным хранить верность супруге, он посещал молодую вдову Кассандру Бонждиане. Только ее родственников, семью Риччи, не устраивала эта связь – они неоднократно предостерегали Пьетро, что дело добром не кончится. Муж Бьянки отвечал угрозами и оскорблениями, поэтому родственники Кассандры постоянно жаловались на него Франческо Медичи. Тот предупреждал Пьетро и советовал ему изменить свое поведение. Бьянка тоже не раз уговаривала мужа быть осторожным, но он никого не слушал. Однажды принц имел долгий разговор с мужчинами из семьи Риччи и на прощание сказал: «Делайте, как пожелаете, мы не обратим внимания на ваше поведение», чем фактически санкционировал убийство мужа своей любовницы. На следующее утро Пьетро Бонавентури был найден мертвым от множества ножевых ранений и удара шпагой по голове. Одновременно с ним Риччи убили и опозорившую семью Кассандру – они задушили женщину в ее собственной постели. Бьянка была свободна от супружеских уз, таким образом, она могла спокойно попытаться родить от Франческо сына и при этом не бояться, что по закону это будет ребенок Бонавентури.

Но как она ни пыталась, беременность не наступала. «Колдунья» не смогла наколдовать себе беременность, она консультировалась с врачами, магами, астрологами, повитухами – но все было напрасно. В 1574 году умер великий герцог Козимо I Медичи, и титул перешел по наследству к его сыну Франческо. А в 1576 году брат Иоанны император Максимилиан не только подтвердил ему титул великого герцога, но и преобразовал его владения в герцогство, над которым не имел власти папа римский. В тот же год произошли две скандальные истории в семье Медичи.