Уничтожение французского флота в Абукирском заливе вскоре привело к появлению на Средиземноморье военных кораблей России и Турции. Высадка французов в Египте стала casus belli[22] для турок. Русские суда, как и прежде, вышли из Кронштадта в начале июня для взаимодействия с британцами в Северном море, но только 24 августа, в результате нового развития событий, русский флот ушел из Севастополя, чтобы присоединиться к туркам для ведения операций за пределами Дарданелл.

Этот флот под командованием вице-адмирала Ушакова состоял из следующих кораблей: «Св. Павел» 84, «Богоявление Господне» 72, «Св. Троица» 72, «Мария Магдалина» 68, «Захарий» и «Елизавета» 74, «Св. Петр» 74, «Григорий Великия Армении» 50, «Св. Михаил» 48, «Навархия Вознесение Господне» 40, «Счастливый» 32, три небольших судна.

Ушаков вошел в Босфор 4 сентября и присоединился к турецкому флоту в Дарданеллах 20-го. Турецкий адмирал Кадир-бей имел в своем распоряжении 6 линкоров, 8 фрегатов, 8 корветов или шлюпов и 14 канонерок, но нехватка людей вынудила его оставить в бездействии 2 линкора, 2 фрегата и 4 корвета. В качестве первого шага два русских фрегата, «Св. Михаил» и «Богородица Казанская», были посланы 25 сентября вместе с двумя турецкими фрегатами и 10 канонерками на соединение с британскими силами в районе Александрии. Остальной сборный флот вышел в море 1 октября.

Группа, идущая в Александрию, сначала зашла на Родос и прибыла к месту назначения только 21 октября. С 21 по 29 октября канонерки с небольшими перерывами обстреливали французский лагерь, но не добились видимого результата. 4 декабря русские и турки ушли к Родосу, а оттуда 2 русских фрегата направились на Корфу, где 20 декабря соединились с флотом Ушакова.

Главные силы русско-турецкого флота подошли к Цериго 9 октября. Два русских фрегата, «Григорий Великия Армении» и «Счастливый», в тот день захватили небольшую крепость Сан-Николо, расположенную на восточном побережье, а тремя днями позже крепость Капсали, что на южном побережье, капитулировала после обстрела этими же двумя фрегатами и кораблем «Панагия Апотуменгана» 14-го. После этого 24 октября эти фрегаты захватили остров Занте, и там Ушаков на некоторое время задержался, отослав три группы кораблей по разным направлениям. Первая группа, которой командовал капитан Пустошкин, состояла из кораблей «Св. Троица» 72, «Сошествие Св. Духа» 44, «Счастливый» 32, «Красноселье» 14 и турецкого фрегата. Она вышла в море 25-го и направилась к Кефалонии, которая сдалась 28-го. Вторая группа под командованием капитана Сенявина имела в своем составе «Св. Петр» 74, «Навархия» 40, турецкий линкор и фрегат. Она вышла в море 29-го и взяла курс на остров Святой Мавры (Лефкада), но там французский гарнизон оказался сильнее и потребовалась осада. Третья группа под командованием капитана Селивачева состояла из кораблей «Захарий» и «Елизавета» 74, «Богоявление Господне» 72 и «Григорий» 50, турецкого линкора и двух фрегатов. Она вышла в море 31 октября и 4 ноября установила блокаду Корфу.