После захвата Корфу русский флот в Адриатическом море начал операции против французов на юге Италии, чтобы поддержать операции армии Суворова на севере. 26 апреля группа из трех больших фрегатов, «Григорий Великия Армении» 50, «Св. Михаил» 48 и «Св. Николай» 46, ушла с Корфу в Бриндизи. Непогода отнесла их в Валону (Авлону) и задержала там до 2 мая. После этого командир подразделения по фамилии Сорокин смог 4 мая восстановить неаполитанскую власть в Бриндизи, 12-го – в Моле и 13-го – в Бари¹².

Другая группа кораблей под командованием контр-адмирала Пустошкина покинула Корфу 12 мая. В нее входили «Св. Михаил» 74, «Симеон и Анна» 74, «Богородица Казанская» 46 и «Навархия» 40, а также турецкий линкор, фрегат, корвет и два или три небольших судна¹³. Два русских фрегата были отправлены в Триест в качестве эскорта для португальского линкора «Райна де Португал» 74, который немного раньше привез беженцев из Бриндизи. Эти фрегаты вернулись только 23 июля. Пустошкин с остальными кораблями подошел к Анконе 17 мая и на следующий день, после отвергнутого требования капитуляции города, в течение нескольких часов вел перестрелку с береговыми батареями и лишенными такелажа бывшими венецианскими кораблями «Лахарп», «Стенгель» и «Бейран», без особого ущерба для обеих сторон. Говорят, что русские потеряли больше от огня своих турецких союзников, чем противника.

На этом этапе на театре военных действий появился небольшой австрийский флот. Австрии, которая во второй раз объявила войну революционной Франции 12 марта 1799 года, с января 1798 года принадлежала Венеция. Прежде чем покинуть порт, французы сделали все от них зависящее, чтобы сделать непригодными к эксплуатации все суда, которые они не могли забрать с собой. Но работа выполнялась в спешке, и австрийцы смогли сразу использовать шхуну «Эгайл» и 11 канонерок и оснастить фрегат и три брига через несколько месяцев. Они также сумели оснастить большое число плоскодонных плавсредств для использования в лагуне и на реке По. Если не считать этих новых приобретений, австрийский военно-морской флот в начале 1798 года состоял из 24-пушечного корвета «Австрия», двух 14-пушечных шебек, «Хенрици» и «Коллоредо», 12 канонерок и нескольких мелких судов.

Сначала австрийцы занимались по большей части обороной Венеции, но через несколько недель их положение улучшилось. Совместной операцией австрийской армии и военно-морского флота были захвачены или уничтожены несколько французских судов на реке По, и австрийская флотилия высвободилась для действий на побережье. Две шебеки были посланы крейсировать по Адриатике, а майор Поттс с 5 канонерками и еще несколькими небольшими судами покинул Кьоджу 28 апреля¹⁴. К этому времени страна уже была охвачена мятежами против французов, и Поттс сумел скоординировать свои действия с повстанцами, захватывая все новые территории. К 30 мая он добрался до Римини, что в 50 милях от Анконы.