Многие острова находятся в южной части дельты. Самые маленькие из них обычно покрыты богатой береговой растительностью и высокими деревьями, наподобие колбасного дерева и мокучумо, но встречаются и другие, например, Ficus sycatnorus, Garcinia livingstonii, Lonchocarpus capassa, Combretum inberbe и наиболее распространенная пальма Hyphaene ventricosa. Крупные острова резко контрастируют с окружением, они окаймлены могучими зелеными деревьями, но, когда проходишь это окаймление, внезапно попадаешь в миниатюрную Калахари. Кругом волны мелкого белого песка, слабо закрепленного разреженными жесткими травяными кочками: кустарники и низкие акации в изобилии снабжены колючками. Здесь жарко, как в аду, и легко понять, почему тут обитают многие типичные животные пустынь и полупустынь.

Большая часть дельты состоит из речных пойм, которые затапливаются на более или менее длительные периоды. В тех местах, которые ненадолго скрываются под водой, преобладают разные виды трав, а там, где вода держится дольше, господствует озерный камыш. Структура растительного покрова в дельте весьма непостоянна, поскольку речная сеть изменяется, когда вода прокладывает себе новое русло.

Значительные участки дельты ежегодно выжигаются. Исследователи единодушно сходятся во мнении, что одноразовое выжигание в основном приносит пользу: исчезает отмершая растительность, являющаяся ненужным балластом, и вода встречает меньше препятствий на своем пути.

Нет более приятного способа путешествовать по дельте Окаванго, чём плыть на бесшумном мукоро. Можно наблюдать белые кувшинки и другие водные растения, видеть рыб, скользящих темными тенями на белом песчаном дне, рассматривать зимородков, цапель, змеешеек, карликовых уток, длиннохвостых больших бакланов, малых поганок и якан, которые водятся в зарослях камыша и тростника, окаймляющих протоки. Весьма распространенный здесь тростник уносит воображение в более северные воды, если бы не пальмы и скопы, кружащие над зарослями тростника и папируса, через которые пробирается мукоро.

Иногда термин "болото" (trask) неудачно применяется и по отношению к Окаванго. Однако вода там настолько чистая, что напрашивается вопрос, является ли обедненность ее питательными веществами результатам нехватки водорослей и других живительных частиц, вследствие чего запасы рыбы относительно невелики и почва бедна питательными веществами.

Из-за недостатка рыбы и водорослей мир водоплавающих птиц здесь не столь богат, как можно было бы ожидать, котя далее к северу, например, в северной части Мореми насчитывается свыше 200 видов птиц. Зато на островах отмечается их большое разнообразие и обилие. Наблюдать за ними там очень интересно: в пределах весьма ограниченной территории можно встретить и типичных водоплавающих птиц и ярко выраженные пустынные виды.