Соглашение насчет принятия мер по урегулированию разногласий ‘Али Салем ал-Бейд и ‘Али ‘Абдалла Салех подписали (20 февраля 1994 г., на встрече в Аммане). Но вот устранить рельефно обозначившийся раскол между политическими элитами южан и северян не представлялось уже возможным. Южнойеменская элита взяла курс на «отпадание» от Йеменской Республики и образование собственного унитарного государства.

Острые политические разногласия вылились в гражданскую войну. Первое военное столкновение между сторонами произошло 27.04.1994 г., у города ‘Амран. Затем, в мае месяце, имели место бои между регулярными частями Севера и Юга в окрестностях Дамара. В начале мая 1994 г., в разгар боевых действий, ‘Али Салем ал-Бейд официально заявил о взятом южанами курсе на отделение и создание независимого государства.

5 мая президент ‘Али Салех ввел в стране чрезвычайное положение и объявил об отстранении ал-Бейда от занимаемой им должности. Деятельность Йеменской социалистической партии оказалась под запретом; ее членов не разрешалось принимать ни на госслужбу, ни в армию. Иными словами, ‘Али ‘Абдалла Салех провел полную чистку госструктур от южан.

В ответ на это, 21 мая 1994 г., ‘Али Салех ал-Бейд провозгласил создание на юге Демократической Республики Йемен.

‘Али Салех квалифицировал данное заявление и все связанные с ним действия ал-Бейда незаконными. Мобилизовал войска, и бросил их на Аден. Северяне вошли в столицу самопровозглашенной Демократической Республики Йемен 7 июля 1994 года. Гражданская война в Йемене закончилась поражением южан (27.04–07.07.1994). Руководство южан в лице лидеров Йеменской социалистической партии и их сторонники массово эмигрировали из страны. Бежали в основном в Султанат Оман. В ходе боев погибло семь тысяч человек; 16 тысяч получили ранения.

Следует отметить, что в войне 1994 г. Саудовская Аравия активно поддерживала южан. Клан ал-Ахмаров и руководимая им исламская партия «Ислах» заняли сторону А. Салеха, и серьезно помогли ему во время наступательной операции на Аден, предоставив в его распоряжение собранное ими и хорошо вооруженное ополчение племени ал-хашид.

Финансово-экономическое положение страны было крайне тяжелым. По состоянию на 1995 г. общий долг Йемена (при численности населения в 16 млн. чел.) составлял 6,2 млрд. долл. США или 155 % валового национального продукта. В стране не хватало воды и электроэнергии. Нефтяная отрасль находилась в руках семейства ‘Али Салеха. Число безработных превышало 35 % от трудоспособного населения на севере страны и более 80 % – на юге. За чертой бедности после окончания гражданской войны оказалось более 45 % граждан.