В конце 1923 – начале 1924 г. по обвинениям в участии в нелегальной организации были сосланы на два года в Енисейскую губернию епископ Н.К. Боголюбов и дьякон И.А. Новиков. Священнослужители обвинялись также в нарушении правил отделения церкви от государства. По этим обвинениям в начале 1924 г. были сосланы в Приангарский край на три года Н.М. Пульхирев и А.В. Прозоров[846]. К июлю 1923 г. в Нарымском крае стояло на учете 14 ссыльных православных священников разных санов[847]. С 1922 г. здесь отбывали ссылку местоблюститель патриаршего престола митрополит Агафангел (А.Л. Преображенский), архиерей Павел Вятский (Борисковский). В это же время в Сибирь был сослан глава Александро-Невского братства лавры иеромонах Л.М. Егоров[848]. К началу 1924 г. в Нарымском крае находилось 27 ссыльных по «религиозному вопросу».

В 1922–1923 гг. параллельно с операциями против «тихоновцев» набирали силу преследования членов религиозных сект. Общины сектантов наделялись признаками «контрреволюционных» организаций. Толстовцы, баптисты, евангелисты, члены Союза христианских молодых людей и прочих объединений брались на особый учет как склонные к «буржуазной реставрации» и «анархо-мещанству», а также как имевшие связи за рубежом. В ноябре 1922 г. антирелигиозная комиссия ЦК РКП(б) дала указание немедленно выслать за границу 7 чел. из числа «руководящего персонала правого крыла толстовцев и “Христианских молодых людей”»[849]. В отношении прочих членов различных сект как к «социально опасным» применялись меры административного воздействия. К началу 1924 г. таковых в Нарымской ссылке насчитывалось 40 чел.[850] В последующие годы численность ссыльных сектантов, в отличие от представителей прочих групп репрессированных, существенно сократилась. В феврале 1927 г. в Нарымском крае стояло на учете шесть репрессированных членов сект.

Во второй половине 1920-х гг. репрессивные мероприятия против представителей духовенства получили развитие. Начиная с 1927 г. проводились массовые аресты участников иосифлянского движения. В сибирской ссылке оказались многие видные представители духовенства. В 1927 г. был сослан на три года в Енисейск митрополит Кирилл (К.К. Смирнов)[851]. В конце 1925 г. был арестован и сослан в Нарымский край епископ Венедикт (В.В. Плотников)[852]. В мае 1926 г. получили срок нарымской ссылки епископы Иннокентий (Б.Д. Тихонов)[853] и Николай (Н.Ф. Клементьев)[854]. В феврале 1928 г. был сослан в Енисейск арестованный за «антисоветское произведение под видом ответа митрополиту Сергию Нижегородскому» протоиерей И.И. Пироженко[855]. В это же время срок ссылки получил протоиерей П.И. Новосельцев[856].