Вестибюль станции «Рыбацкое» представляет собой массивное протяженное здание из стекла и бетона, входящее в комплекс строений одноименной железнодорожной станции. Он расположен между Тепловозной улицей и 3-м Рыбацким проездом. При строительстве кровли станции применено новаторское инженерное решение – складчатое 18-пролетное перекрытие, позволяющее свободно компоновать станционные сооружения.

Проход к поездам метрополитена из подземного перехода под железнодорожными путями. Изначально на станции имелись три малых эскалатора, поднимавших пассажиров в кассовый зал. Во время ремонта 2000–2001 гг. эскалаторы демонтировали и заменили широкой лестницей.

На станции имеются три платформы – две боковые и средняя, служебная, для перехода машиниста в головной вагон при обороте. При этом платформа выхода вдвое шире платформы посадки. За счет окон, расположенных по всей длине станции, в светлое время суток станция освещается дневным светом.

В отделке станции использованы белый и серый мрамор, профильный металл, стекло, полированный гранит пола. В северном и южном торцах станции над путями расположены большие балконы, но доступ для пассажиров на них закрыт.

Подземный пешеходный тоннель под железнодорожными путями впервые в практике строительства метрополитена сооружался методом продавливания, что позволило не останавливать движение поездов по железной дороге.

Прежде на платформы железной дороги можно было попасть непосредственно из подземного перехода, что было очень удобно для транзитных пассажиров. Но с введением билетного контроля выходы на платформы замуровали. Теперь, чтобы попасть из метро на электричку, требуется спуститься в подземный переход, пройти по нему, подняться на поверхность, пройти через турникеты билетного зала, выйти на платформу № 1, подняться по высоченной лестнице, пройти по переходу над путями и спуститься на нужную платформу. Возможно, это сократило количество «зайцев», но потребовало больших затрат и привело к колоссальным неудобствам для пассажиров. Кстати, открывали этот переход в 2006 г. с большой помпой и с большим железнодорожным начальством.

В свое время собирались устроить кросс-платформенную пересадку из метрополитена на пригородные поезда (аналогично станции «Девяткино»), есть даже задел под выход к поездам из кассового зала, почти построили второй (северный) подземный переход, но теперь в нем уже нет смысла.

В 2009 г. на железнодорожной станции «Обухово» построили первую очередь многофункционального вокзального комплекса обслуживания пассажиров, в 2016 г. ввели в эксплуатацию вторую очередь.