Однако Ваган в какой-то степени чувствовал симпатию к греческому православию и в особенности, как уверяет Степанос Орбелян, к внешним формам православного культа, которые были в ходу в Грузии. Это действительно правда: очень похоже, что Ваган велел привезти в Армению из Грузии иконы греко-православного типа и в какой-то степени симпатизировал халкидонскому учению о Христе. Асохик пишет, что «он не скрывал своего сильного желания объединиться с халкидонцами». Киракос Гандзакеци утверждает, что Ваган «договорился с иберами о единстве символики». А Степанос Орбелян рассказывает, какие чувства вызвало такое поведение: «Он договорился с греками и желает ввести их ересь в нашу церковь» – вот что подозревали все, кричали это царю и добились, что он их услышал. Тогда Ашот III собрал в Ани собор, на котором присутствовали многие епископы и монахи. Асохик перечисляет главных из них: «господин Хачик, епископ Аршаруника (будущий патриарх Хачик I), отец Поликарпос, настоятель монастыря Камртджатцор, отец Саргис, монах из Хоромоц-Ванка, отец Степанос, монах из монастыря на Севане».
Патриарх Ваган решил не появляться перед участниками собора. Он укрылся в Васпуракане, у царя этого государства Абусахла-Хамазаспа. Собор в Ани выбрал на его место монаха Степаноса с Севана, который был возведен католикосом Агуании Ховханнесом в сан патриарха и стал Степаносом III (969).
Армения оказалась разделена чем-то вроде Великого Раскола[387]. В ней были два патриарха – Степанос III, которого признавал на севере царь-Багратид из Ани, и Ваган, которого продолжал признавать на юге царь Васпураканский из рода Арцруни. «С обеих сторон они наполнили Армению отлучениями», – пишет Асохик. Наконец Степанос III поступил решительно. «Собрав большое количество монахов из Тарона, Хаштеанка, Дзопка и Хортзена», он приехал в Васпуракан и стал упрекать Вагана и царя Абусахла-Хамазаспа за их поведение. Но государь из рода Арцруни и прелат, которого он защищал, не дали себя запугать. Они ответили категорическим отказом принимать Степаноса – «не пожелали ни видеть, ни слышать его», затем арестовали его и выслали на остров Ахтамар вместе с двумя его спутниками – вардапетом Моисеем и монахом Бабгеном. Позже они согласились освободить Моисея и Бабгена, но Степаноса отослали в крепость Которк, находившуюся в области Антцахитцор, на границе с пограничной областью Гер (Хой). Вскоре несчастный патриарх там умер (971). Его соперник Ваган, видимо, на какое-то время его пережил; до конца его жизни васпураканская царская семья почитала его, а когда он умер, похоронила его в Дзоро-Ванке рядом с древними патриархами, жившими в Васпуракане.